Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBZ0

CCDC110, Coiled-coil domain-containing protein 110, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC110Q8TBZ0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC110Q8TBZ0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC110Q8TBZ0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC110Q8TBZ0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC110Q8TBZ0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC110Q8TBZ0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC110Q8TBZ0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC110Q8TBZ0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC110Q8TBZ0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC110Q8TBZ0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC110Q8TBZ0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC110Q8TBZ0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC110Q8TBZ0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC110Q8TBZ0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC110Q8TBZ0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC110Q8TBZ0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC110Q8TBZ0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC110Q8TBZ0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC110Q8TBZ0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC110Q8TBZ0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC110Q8TBZ0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC110Q8TBZ0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC110Q8TBZ0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC110Q8TBZ0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC110Q8TBZ0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC110Q8TBZ0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC110Q8TBZ0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC110Q8TBZ0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC110Q8TBZ0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC110Q8TBZ0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC110Q8TBZ0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC110Q8TBZ0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC110Q8TBZ0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC110Q8TBZ0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC110Q8TBZ0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC110Q8TBZ0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC110Q8TBZ0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC110Q8TBZ0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC110Q8TBZ0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC110Q8TBZ0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC110Q8TBZ0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC110Q8TBZ0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC110Q8TBZ0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC110Q8TBZ0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC110Q8TBZ0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC110Q8TBZ0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC110Q8TBZ0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC110Q8TBZ0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC110Q8TBZ0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC110Q8TBZ0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC110Q8TBZ0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC110Q8TBZ0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC110Q8TBZ0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC110Q8TBZ0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC110Q8TBZ0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC110Q8TBZ0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC110Q8TBZ0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC110Q8TBZ0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC110Q8TBZ0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC110Q8TBZ0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC110Q8TBZ0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC110Q8TBZ0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC110Q8TBZ0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC110Q8TBZ0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC110Q8TBZ0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC110Q8TBZ0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC110Q8TBZ0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC110Q8TBZ0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC110Q8TBZ0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC110Q8TBZ0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC110Q8TBZ0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC110Q8TBZ0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC110Q8TBZ0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC110Q8TBZ0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC110Q8TBZ0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC110Q8TBZ0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC110Q8TBZ0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC110Q8TBZ0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC110Q8TBZ0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC110Q8TBZ0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC110Q8TBZ0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC110Q8TBZ0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC110Q8TBZ0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC110Q8TBZ0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC110Q8TBZ0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC110Q8TBZ0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC110Q8TBZ0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC110Q8TBZ0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC110Q8TBZ0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC110Q8TBZ0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC110Q8TBZ0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC110Q8TBZ0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC110Q8TBZ0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC110Q8TBZ0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC110Q8TBZ0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC110Q8TBZ0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC110Q8TBZ0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC110Q8TBZ0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC110Q8TBZ0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC110Q8TBZ0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms