Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
ZNF397Q8NF99 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ZNF397Q8NF99 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ZNF397Q8NF99 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
ZNF397Q8NF99 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
ZNF397Q8NF99 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
ZNF397Q8NF99 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
ZNF397Q8NF99 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
ZNF397Q8NF99 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
ZNF397Q8NF99 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
ZNF397Q8NF99 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
ZNF397Q8NF99 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
ZNF397Q8NF99 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ZNF397Q8NF99 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ZNF397Q8NF99 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
ZNF397Q8NF99 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
ZNF397Q8NF99 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ZNF397Q8NF99 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
ZNF397Q8NF99 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
ZNF397Q8NF99 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
ZNF397Q8NF99 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
ZNF397Q8NF99 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
ZNF397Q8NF99 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
ZNF397Q8NF99 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
ZNF397Q8NF99 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
ZNF397Q8NF99 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.3■■■□□ 2.44
ZNF397Q8NF99 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
ZNF397Q8NF99 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ZNF397Q8NF99 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
ZNF397Q8NF99 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ZNF397Q8NF99 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ZNF397Q8NF99 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ZNF397Q8NF99 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ZNF397Q8NF99 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
ZNF397Q8NF99 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
ZNF397Q8NF99 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ZNF397Q8NF99 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ZNF397Q8NF99 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ZNF397Q8NF99 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ZNF397Q8NF99 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ZNF397Q8NF99 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ZNF397Q8NF99 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ZNF397Q8NF99 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ZNF397Q8NF99 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ZNF397Q8NF99 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ZNF397Q8NF99 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ZNF397Q8NF99 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
ZNF397Q8NF99 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ZNF397Q8NF99 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ZNF397Q8NF99 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ZNF397Q8NF99 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ZNF397Q8NF99 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ZNF397Q8NF99 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ZNF397Q8NF99 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ZNF397Q8NF99 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ZNF397Q8NF99 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ZNF397Q8NF99 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ZNF397Q8NF99 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ZNF397Q8NF99 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ZNF397Q8NF99 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ZNF397Q8NF99 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
ZNF397Q8NF99 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ZNF397Q8NF99 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ZNF397Q8NF99 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ZNF397Q8NF99 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ZNF397Q8NF99 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ZNF397Q8NF99 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
ZNF397Q8NF99 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
ZNF397Q8NF99 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ZNF397Q8NF99 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ZNF397Q8NF99 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
ZNF397Q8NF99 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ZNF397Q8NF99 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ZNF397Q8NF99 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ZNF397Q8NF99 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ZNF397Q8NF99 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ZNF397Q8NF99 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ZNF397Q8NF99 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ZNF397Q8NF99 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
ZNF397Q8NF99 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ZNF397Q8NF99 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ZNF397Q8NF99 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
ZNF397Q8NF99 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ZNF397Q8NF99 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ZNF397Q8NF99 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ZNF397Q8NF99 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ZNF397Q8NF99 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ZNF397Q8NF99 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ZNF397Q8NF99 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
ZNF397Q8NF99 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ZNF397Q8NF99 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ZNF397Q8NF99 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ZNF397Q8NF99 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
ZNF397Q8NF99 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ZNF397Q8NF99 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
ZNF397Q8NF99 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ZNF397Q8NF99 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ZNF397Q8NF99 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ZNF397Q8NF99 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ZNF397Q8NF99 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms