Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEC5

CATSPER1, Cation channel sperm-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER1Q8NEC5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CATSPER1Q8NEC5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CATSPER1Q8NEC5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CATSPER1Q8NEC5 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CATSPER1Q8NEC5 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CATSPER1Q8NEC5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CATSPER1Q8NEC5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CATSPER1Q8NEC5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CATSPER1Q8NEC5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CATSPER1Q8NEC5 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CATSPER1Q8NEC5 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CATSPER1Q8NEC5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CATSPER1Q8NEC5 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CATSPER1Q8NEC5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CATSPER1Q8NEC5 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CATSPER1Q8NEC5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CATSPER1Q8NEC5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CATSPER1Q8NEC5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CATSPER1Q8NEC5 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CATSPER1Q8NEC5 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CATSPER1Q8NEC5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CATSPER1Q8NEC5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CATSPER1Q8NEC5 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CATSPER1Q8NEC5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CATSPER1Q8NEC5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CATSPER1Q8NEC5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CATSPER1Q8NEC5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CATSPER1Q8NEC5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CATSPER1Q8NEC5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CATSPER1Q8NEC5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CATSPER1Q8NEC5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CATSPER1Q8NEC5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CATSPER1Q8NEC5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CATSPER1Q8NEC5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CATSPER1Q8NEC5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CATSPER1Q8NEC5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CATSPER1Q8NEC5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CATSPER1Q8NEC5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CATSPER1Q8NEC5 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CATSPER1Q8NEC5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CATSPER1Q8NEC5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CATSPER1Q8NEC5 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CATSPER1Q8NEC5 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CATSPER1Q8NEC5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CATSPER1Q8NEC5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CATSPER1Q8NEC5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CATSPER1Q8NEC5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CATSPER1Q8NEC5 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CATSPER1Q8NEC5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CATSPER1Q8NEC5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CATSPER1Q8NEC5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CATSPER1Q8NEC5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CATSPER1Q8NEC5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CATSPER1Q8NEC5 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CATSPER1Q8NEC5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CATSPER1Q8NEC5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CATSPER1Q8NEC5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CATSPER1Q8NEC5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CATSPER1Q8NEC5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CATSPER1Q8NEC5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CATSPER1Q8NEC5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CATSPER1Q8NEC5 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CATSPER1Q8NEC5 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CATSPER1Q8NEC5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CATSPER1Q8NEC5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CATSPER1Q8NEC5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CATSPER1Q8NEC5 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CATSPER1Q8NEC5 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CATSPER1Q8NEC5 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CATSPER1Q8NEC5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CATSPER1Q8NEC5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CATSPER1Q8NEC5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CATSPER1Q8NEC5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CATSPER1Q8NEC5 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CATSPER1Q8NEC5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CATSPER1Q8NEC5 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CATSPER1Q8NEC5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CATSPER1Q8NEC5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CATSPER1Q8NEC5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CATSPER1Q8NEC5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CATSPER1Q8NEC5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CATSPER1Q8NEC5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CATSPER1Q8NEC5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CATSPER1Q8NEC5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CATSPER1Q8NEC5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CATSPER1Q8NEC5 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CATSPER1Q8NEC5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CATSPER1Q8NEC5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CATSPER1Q8NEC5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CATSPER1Q8NEC5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CATSPER1Q8NEC5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CATSPER1Q8NEC5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CATSPER1Q8NEC5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CATSPER1Q8NEC5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CATSPER1Q8NEC5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CATSPER1Q8NEC5 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CATSPER1Q8NEC5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CATSPER1Q8NEC5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CATSPER1Q8NEC5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CATSPER1Q8NEC5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms