Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PIK3C3Q8NEB9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PIK3C3Q8NEB9 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PIK3C3Q8NEB9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PIK3C3Q8NEB9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PIK3C3Q8NEB9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PIK3C3Q8NEB9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PIK3C3Q8NEB9 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PIK3C3Q8NEB9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PIK3C3Q8NEB9 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
PIK3C3Q8NEB9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PIK3C3Q8NEB9 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PIK3C3Q8NEB9 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PIK3C3Q8NEB9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PIK3C3Q8NEB9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PIK3C3Q8NEB9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PIK3C3Q8NEB9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PIK3C3Q8NEB9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PIK3C3Q8NEB9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PIK3C3Q8NEB9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIK3C3Q8NEB9 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIK3C3Q8NEB9 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PIK3C3Q8NEB9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PIK3C3Q8NEB9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PIK3C3Q8NEB9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PIK3C3Q8NEB9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PIK3C3Q8NEB9 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PIK3C3Q8NEB9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PIK3C3Q8NEB9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PIK3C3Q8NEB9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PIK3C3Q8NEB9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PIK3C3Q8NEB9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PIK3C3Q8NEB9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PIK3C3Q8NEB9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PIK3C3Q8NEB9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PIK3C3Q8NEB9 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PIK3C3Q8NEB9 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PIK3C3Q8NEB9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PIK3C3Q8NEB9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PIK3C3Q8NEB9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PIK3C3Q8NEB9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PIK3C3Q8NEB9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PIK3C3Q8NEB9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PIK3C3Q8NEB9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PIK3C3Q8NEB9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PIK3C3Q8NEB9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PIK3C3Q8NEB9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
PIK3C3Q8NEB9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PIK3C3Q8NEB9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PIK3C3Q8NEB9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PIK3C3Q8NEB9 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PIK3C3Q8NEB9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PIK3C3Q8NEB9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PIK3C3Q8NEB9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PIK3C3Q8NEB9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PIK3C3Q8NEB9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PIK3C3Q8NEB9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PIK3C3Q8NEB9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PIK3C3Q8NEB9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PIK3C3Q8NEB9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PIK3C3Q8NEB9 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PIK3C3Q8NEB9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PIK3C3Q8NEB9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PIK3C3Q8NEB9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PIK3C3Q8NEB9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PIK3C3Q8NEB9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PIK3C3Q8NEB9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PIK3C3Q8NEB9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PIK3C3Q8NEB9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PIK3C3Q8NEB9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PIK3C3Q8NEB9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PIK3C3Q8NEB9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PIK3C3Q8NEB9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PIK3C3Q8NEB9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PIK3C3Q8NEB9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PIK3C3Q8NEB9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PIK3C3Q8NEB9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PIK3C3Q8NEB9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PIK3C3Q8NEB9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PIK3C3Q8NEB9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PIK3C3Q8NEB9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PIK3C3Q8NEB9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PIK3C3Q8NEB9 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PIK3C3Q8NEB9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PIK3C3Q8NEB9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PIK3C3Q8NEB9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PIK3C3Q8NEB9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PIK3C3Q8NEB9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PIK3C3Q8NEB9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PIK3C3Q8NEB9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PIK3C3Q8NEB9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PIK3C3Q8NEB9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PIK3C3Q8NEB9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PIK3C3Q8NEB9 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PIK3C3Q8NEB9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PIK3C3Q8NEB9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PIK3C3Q8NEB9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PIK3C3Q8NEB9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PIK3C3Q8NEB9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PIK3C3Q8NEB9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms