Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA58

PNLDC1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNLDC1Q8NA58 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PNLDC1Q8NA58 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PNLDC1Q8NA58 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PNLDC1Q8NA58 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PNLDC1Q8NA58 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PNLDC1Q8NA58 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PNLDC1Q8NA58 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PNLDC1Q8NA58 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PNLDC1Q8NA58 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PNLDC1Q8NA58 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PNLDC1Q8NA58 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PNLDC1Q8NA58 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PNLDC1Q8NA58 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PNLDC1Q8NA58 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PNLDC1Q8NA58 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PNLDC1Q8NA58 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PNLDC1Q8NA58 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PNLDC1Q8NA58 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PNLDC1Q8NA58 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PNLDC1Q8NA58 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PNLDC1Q8NA58 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PNLDC1Q8NA58 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PNLDC1Q8NA58 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PNLDC1Q8NA58 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PNLDC1Q8NA58 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PNLDC1Q8NA58 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PNLDC1Q8NA58 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PNLDC1Q8NA58 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PNLDC1Q8NA58 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PNLDC1Q8NA58 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PNLDC1Q8NA58 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PNLDC1Q8NA58 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PNLDC1Q8NA58 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PNLDC1Q8NA58 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PNLDC1Q8NA58 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PNLDC1Q8NA58 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PNLDC1Q8NA58 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PNLDC1Q8NA58 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PNLDC1Q8NA58 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PNLDC1Q8NA58 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PNLDC1Q8NA58 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PNLDC1Q8NA58 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PNLDC1Q8NA58 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PNLDC1Q8NA58 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PNLDC1Q8NA58 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PNLDC1Q8NA58 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PNLDC1Q8NA58 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PNLDC1Q8NA58 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PNLDC1Q8NA58 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PNLDC1Q8NA58 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PNLDC1Q8NA58 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PNLDC1Q8NA58 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PNLDC1Q8NA58 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PNLDC1Q8NA58 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PNLDC1Q8NA58 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PNLDC1Q8NA58 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PNLDC1Q8NA58 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PNLDC1Q8NA58 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PNLDC1Q8NA58 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PNLDC1Q8NA58 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PNLDC1Q8NA58 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PNLDC1Q8NA58 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PNLDC1Q8NA58 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PNLDC1Q8NA58 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PNLDC1Q8NA58 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PNLDC1Q8NA58 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PNLDC1Q8NA58 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PNLDC1Q8NA58 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PNLDC1Q8NA58 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PNLDC1Q8NA58 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PNLDC1Q8NA58 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PNLDC1Q8NA58 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PNLDC1Q8NA58 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PNLDC1Q8NA58 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PNLDC1Q8NA58 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PNLDC1Q8NA58 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PNLDC1Q8NA58 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PNLDC1Q8NA58 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PNLDC1Q8NA58 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PNLDC1Q8NA58 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PNLDC1Q8NA58 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PNLDC1Q8NA58 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PNLDC1Q8NA58 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PNLDC1Q8NA58 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PNLDC1Q8NA58 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PNLDC1Q8NA58 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PNLDC1Q8NA58 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PNLDC1Q8NA58 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PNLDC1Q8NA58 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PNLDC1Q8NA58 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PNLDC1Q8NA58 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PNLDC1Q8NA58 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PNLDC1Q8NA58 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PNLDC1Q8NA58 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PNLDC1Q8NA58 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PNLDC1Q8NA58 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PNLDC1Q8NA58 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PNLDC1Q8NA58 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PNLDC1Q8NA58 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PNLDC1Q8NA58 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms