Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9S9

SNX31, Sorting nexin-31, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX31Q8N9S9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SNX31Q8N9S9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SNX31Q8N9S9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SNX31Q8N9S9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SNX31Q8N9S9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SNX31Q8N9S9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SNX31Q8N9S9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SNX31Q8N9S9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SNX31Q8N9S9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SNX31Q8N9S9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SNX31Q8N9S9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SNX31Q8N9S9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SNX31Q8N9S9 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SNX31Q8N9S9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SNX31Q8N9S9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SNX31Q8N9S9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SNX31Q8N9S9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SNX31Q8N9S9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SNX31Q8N9S9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SNX31Q8N9S9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SNX31Q8N9S9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SNX31Q8N9S9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SNX31Q8N9S9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SNX31Q8N9S9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SNX31Q8N9S9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SNX31Q8N9S9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SNX31Q8N9S9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SNX31Q8N9S9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SNX31Q8N9S9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SNX31Q8N9S9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SNX31Q8N9S9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SNX31Q8N9S9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SNX31Q8N9S9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SNX31Q8N9S9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SNX31Q8N9S9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SNX31Q8N9S9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SNX31Q8N9S9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SNX31Q8N9S9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SNX31Q8N9S9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
SNX31Q8N9S9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SNX31Q8N9S9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SNX31Q8N9S9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SNX31Q8N9S9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SNX31Q8N9S9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SNX31Q8N9S9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SNX31Q8N9S9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SNX31Q8N9S9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SNX31Q8N9S9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SNX31Q8N9S9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SNX31Q8N9S9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SNX31Q8N9S9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SNX31Q8N9S9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SNX31Q8N9S9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SNX31Q8N9S9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SNX31Q8N9S9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SNX31Q8N9S9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SNX31Q8N9S9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SNX31Q8N9S9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SNX31Q8N9S9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SNX31Q8N9S9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SNX31Q8N9S9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SNX31Q8N9S9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SNX31Q8N9S9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SNX31Q8N9S9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SNX31Q8N9S9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNX31Q8N9S9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNX31Q8N9S9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNX31Q8N9S9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNX31Q8N9S9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNX31Q8N9S9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNX31Q8N9S9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNX31Q8N9S9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SNX31Q8N9S9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SNX31Q8N9S9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SNX31Q8N9S9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SNX31Q8N9S9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SNX31Q8N9S9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SNX31Q8N9S9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SNX31Q8N9S9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SNX31Q8N9S9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SNX31Q8N9S9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SNX31Q8N9S9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SNX31Q8N9S9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SNX31Q8N9S9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SNX31Q8N9S9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SNX31Q8N9S9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SNX31Q8N9S9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SNX31Q8N9S9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SNX31Q8N9S9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SNX31Q8N9S9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SNX31Q8N9S9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SNX31Q8N9S9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SNX31Q8N9S9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SNX31Q8N9S9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SNX31Q8N9S9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SNX31Q8N9S9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SNX31Q8N9S9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SNX31Q8N9S9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SNX31Q8N9S9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SNX31Q8N9S9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.8 ms