Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5X7

EIF4E3, Eukaryotic translation initiation factor 4E type 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4E3Q8N5X7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF4E3Q8N5X7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF4E3Q8N5X7 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF4E3Q8N5X7 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF4E3Q8N5X7 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF4E3Q8N5X7 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIF4E3Q8N5X7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIF4E3Q8N5X7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EIF4E3Q8N5X7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EIF4E3Q8N5X7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EIF4E3Q8N5X7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EIF4E3Q8N5X7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF4E3Q8N5X7 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF4E3Q8N5X7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF4E3Q8N5X7 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF4E3Q8N5X7 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF4E3Q8N5X7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF4E3Q8N5X7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EIF4E3Q8N5X7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EIF4E3Q8N5X7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EIF4E3Q8N5X7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EIF4E3Q8N5X7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EIF4E3Q8N5X7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EIF4E3Q8N5X7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EIF4E3Q8N5X7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EIF4E3Q8N5X7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EIF4E3Q8N5X7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EIF4E3Q8N5X7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EIF4E3Q8N5X7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EIF4E3Q8N5X7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EIF4E3Q8N5X7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EIF4E3Q8N5X7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EIF4E3Q8N5X7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
EIF4E3Q8N5X7 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
EIF4E3Q8N5X7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EIF4E3Q8N5X7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF4E3Q8N5X7 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF4E3Q8N5X7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF4E3Q8N5X7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF4E3Q8N5X7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF4E3Q8N5X7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF4E3Q8N5X7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF4E3Q8N5X7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF4E3Q8N5X7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF4E3Q8N5X7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF4E3Q8N5X7 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF4E3Q8N5X7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EIF4E3Q8N5X7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EIF4E3Q8N5X7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EIF4E3Q8N5X7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EIF4E3Q8N5X7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EIF4E3Q8N5X7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EIF4E3Q8N5X7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF4E3Q8N5X7 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF4E3Q8N5X7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF4E3Q8N5X7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF4E3Q8N5X7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF4E3Q8N5X7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
EIF4E3Q8N5X7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
EIF4E3Q8N5X7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EIF4E3Q8N5X7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EIF4E3Q8N5X7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF4E3Q8N5X7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF4E3Q8N5X7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF4E3Q8N5X7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF4E3Q8N5X7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EIF4E3Q8N5X7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF4E3Q8N5X7 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF4E3Q8N5X7 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF4E3Q8N5X7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF4E3Q8N5X7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF4E3Q8N5X7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF4E3Q8N5X7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF4E3Q8N5X7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF4E3Q8N5X7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF4E3Q8N5X7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF4E3Q8N5X7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF4E3Q8N5X7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF4E3Q8N5X7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF4E3Q8N5X7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF4E3Q8N5X7 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF4E3Q8N5X7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF4E3Q8N5X7 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF4E3Q8N5X7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF4E3Q8N5X7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF4E3Q8N5X7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF4E3Q8N5X7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF4E3Q8N5X7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF4E3Q8N5X7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF4E3Q8N5X7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF4E3Q8N5X7 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF4E3Q8N5X7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF4E3Q8N5X7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF4E3Q8N5X7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF4E3Q8N5X7 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF4E3Q8N5X7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF4E3Q8N5X7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF4E3Q8N5X7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EIF4E3Q8N5X7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EIF4E3Q8N5X7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms