Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0U7

C1orf87, Uncharacterized protein C1orf87, humanhuman

Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf87Q8N0U7 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C1orf87Q8N0U7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C1orf87Q8N0U7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1orf87Q8N0U7 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1orf87Q8N0U7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1orf87Q8N0U7 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C1orf87Q8N0U7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1orf87Q8N0U7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1orf87Q8N0U7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1orf87Q8N0U7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
C1orf87Q8N0U7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
C1orf87Q8N0U7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1orf87Q8N0U7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1orf87Q8N0U7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1orf87Q8N0U7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1orf87Q8N0U7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C1orf87Q8N0U7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C1orf87Q8N0U7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C1orf87Q8N0U7 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C1orf87Q8N0U7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C1orf87Q8N0U7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C1orf87Q8N0U7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C1orf87Q8N0U7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1orf87Q8N0U7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1orf87Q8N0U7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1orf87Q8N0U7 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1orf87Q8N0U7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C1orf87Q8N0U7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C1orf87Q8N0U7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C1orf87Q8N0U7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C1orf87Q8N0U7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C1orf87Q8N0U7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C1orf87Q8N0U7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C1orf87Q8N0U7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C1orf87Q8N0U7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C1orf87Q8N0U7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C1orf87Q8N0U7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
C1orf87Q8N0U7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1orf87Q8N0U7 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1orf87Q8N0U7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1orf87Q8N0U7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1orf87Q8N0U7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1orf87Q8N0U7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1orf87Q8N0U7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1orf87Q8N0U7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1orf87Q8N0U7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C1orf87Q8N0U7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C1orf87Q8N0U7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C1orf87Q8N0U7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C1orf87Q8N0U7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C1orf87Q8N0U7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C1orf87Q8N0U7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C1orf87Q8N0U7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C1orf87Q8N0U7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C1orf87Q8N0U7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C1orf87Q8N0U7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C1orf87Q8N0U7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C1orf87Q8N0U7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C1orf87Q8N0U7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C1orf87Q8N0U7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C1orf87Q8N0U7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C1orf87Q8N0U7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C1orf87Q8N0U7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C1orf87Q8N0U7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
C1orf87Q8N0U7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C1orf87Q8N0U7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C1orf87Q8N0U7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C1orf87Q8N0U7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C1orf87Q8N0U7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
C1orf87Q8N0U7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1orf87Q8N0U7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1orf87Q8N0U7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1orf87Q8N0U7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1orf87Q8N0U7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C1orf87Q8N0U7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C1orf87Q8N0U7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C1orf87Q8N0U7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C1orf87Q8N0U7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C1orf87Q8N0U7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C1orf87Q8N0U7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
C1orf87Q8N0U7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
C1orf87Q8N0U7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C1orf87Q8N0U7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C1orf87Q8N0U7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C1orf87Q8N0U7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C1orf87Q8N0U7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C1orf87Q8N0U7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C1orf87Q8N0U7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C1orf87Q8N0U7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C1orf87Q8N0U7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C1orf87Q8N0U7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C1orf87Q8N0U7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C1orf87Q8N0U7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
C1orf87Q8N0U7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C1orf87Q8N0U7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C1orf87Q8N0U7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C1orf87Q8N0U7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
C1orf87Q8N0U7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C1orf87Q8N0U7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C1orf87Q8N0U7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms