Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZY2

ABCA7, ATP-binding cassette sub-family A member 7, humanhuman

Predictions only

Length 2,146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCA7Q8IZY2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ABCA7Q8IZY2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ABCA7Q8IZY2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
ABCA7Q8IZY2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ABCA7Q8IZY2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ABCA7Q8IZY2 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ABCA7Q8IZY2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ABCA7Q8IZY2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCA7Q8IZY2 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ABCA7Q8IZY2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCA7Q8IZY2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCA7Q8IZY2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCA7Q8IZY2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABCA7Q8IZY2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ABCA7Q8IZY2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ABCA7Q8IZY2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCA7Q8IZY2 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ABCA7Q8IZY2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
ABCA7Q8IZY2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ABCA7Q8IZY2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCA7Q8IZY2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ABCA7Q8IZY2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ABCA7Q8IZY2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ABCA7Q8IZY2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ABCA7Q8IZY2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ABCA7Q8IZY2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ABCA7Q8IZY2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ABCA7Q8IZY2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
ABCA7Q8IZY2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ABCA7Q8IZY2 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ABCA7Q8IZY2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
ABCA7Q8IZY2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
ABCA7Q8IZY2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCA7Q8IZY2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCA7Q8IZY2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ABCA7Q8IZY2 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ABCA7Q8IZY2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ABCA7Q8IZY2 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ABCA7Q8IZY2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ABCA7Q8IZY2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
ABCA7Q8IZY2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ABCA7Q8IZY2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ABCA7Q8IZY2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ABCA7Q8IZY2 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ABCA7Q8IZY2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ABCA7Q8IZY2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
ABCA7Q8IZY2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ABCA7Q8IZY2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ABCA7Q8IZY2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ABCA7Q8IZY2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
ABCA7Q8IZY2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ABCA7Q8IZY2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ABCA7Q8IZY2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ABCA7Q8IZY2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ABCA7Q8IZY2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
ABCA7Q8IZY2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ABCA7Q8IZY2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
ABCA7Q8IZY2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ABCA7Q8IZY2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ABCA7Q8IZY2 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ABCA7Q8IZY2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ABCA7Q8IZY2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ABCA7Q8IZY2 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ABCA7Q8IZY2 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ABCA7Q8IZY2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ABCA7Q8IZY2 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCA7Q8IZY2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCA7Q8IZY2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCA7Q8IZY2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCA7Q8IZY2 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCA7Q8IZY2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCA7Q8IZY2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCA7Q8IZY2 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ABCA7Q8IZY2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCA7Q8IZY2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCA7Q8IZY2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCA7Q8IZY2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCA7Q8IZY2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCA7Q8IZY2 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCA7Q8IZY2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCA7Q8IZY2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCA7Q8IZY2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCA7Q8IZY2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ABCA7Q8IZY2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ABCA7Q8IZY2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
ABCA7Q8IZY2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ABCA7Q8IZY2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ABCA7Q8IZY2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ABCA7Q8IZY2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
ABCA7Q8IZY2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
ABCA7Q8IZY2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ABCA7Q8IZY2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ABCA7Q8IZY2 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
ABCA7Q8IZY2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ABCA7Q8IZY2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ABCA7Q8IZY2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ABCA7Q8IZY2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ABCA7Q8IZY2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCA7Q8IZY2 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCA7Q8IZY2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms