Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWV2

CNTN4, Contactin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN4Q8IWV2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CNTN4Q8IWV2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CNTN4Q8IWV2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CNTN4Q8IWV2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CNTN4Q8IWV2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CNTN4Q8IWV2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CNTN4Q8IWV2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CNTN4Q8IWV2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CNTN4Q8IWV2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CNTN4Q8IWV2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CNTN4Q8IWV2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CNTN4Q8IWV2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CNTN4Q8IWV2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CNTN4Q8IWV2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CNTN4Q8IWV2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CNTN4Q8IWV2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CNTN4Q8IWV2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CNTN4Q8IWV2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CNTN4Q8IWV2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CNTN4Q8IWV2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CNTN4Q8IWV2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CNTN4Q8IWV2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CNTN4Q8IWV2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CNTN4Q8IWV2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CNTN4Q8IWV2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CNTN4Q8IWV2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CNTN4Q8IWV2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CNTN4Q8IWV2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CNTN4Q8IWV2 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CNTN4Q8IWV2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CNTN4Q8IWV2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CNTN4Q8IWV2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CNTN4Q8IWV2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CNTN4Q8IWV2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CNTN4Q8IWV2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CNTN4Q8IWV2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CNTN4Q8IWV2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CNTN4Q8IWV2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNTN4Q8IWV2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNTN4Q8IWV2 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CNTN4Q8IWV2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CNTN4Q8IWV2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CNTN4Q8IWV2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CNTN4Q8IWV2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CNTN4Q8IWV2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CNTN4Q8IWV2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CNTN4Q8IWV2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CNTN4Q8IWV2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CNTN4Q8IWV2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CNTN4Q8IWV2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CNTN4Q8IWV2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CNTN4Q8IWV2 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CNTN4Q8IWV2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CNTN4Q8IWV2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CNTN4Q8IWV2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CNTN4Q8IWV2 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CNTN4Q8IWV2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CNTN4Q8IWV2 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CNTN4Q8IWV2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CNTN4Q8IWV2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CNTN4Q8IWV2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CNTN4Q8IWV2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CNTN4Q8IWV2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CNTN4Q8IWV2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CNTN4Q8IWV2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CNTN4Q8IWV2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CNTN4Q8IWV2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CNTN4Q8IWV2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CNTN4Q8IWV2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CNTN4Q8IWV2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CNTN4Q8IWV2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CNTN4Q8IWV2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CNTN4Q8IWV2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CNTN4Q8IWV2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CNTN4Q8IWV2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CNTN4Q8IWV2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CNTN4Q8IWV2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CNTN4Q8IWV2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CNTN4Q8IWV2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CNTN4Q8IWV2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CNTN4Q8IWV2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CNTN4Q8IWV2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CNTN4Q8IWV2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CNTN4Q8IWV2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.96
CNTN4Q8IWV2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CNTN4Q8IWV2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CNTN4Q8IWV2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CNTN4Q8IWV2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNTN4Q8IWV2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNTN4Q8IWV2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNTN4Q8IWV2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CNTN4Q8IWV2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CNTN4Q8IWV2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CNTN4Q8IWV2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CNTN4Q8IWV2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CNTN4Q8IWV2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CNTN4Q8IWV2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CNTN4Q8IWV2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CNTN4Q8IWV2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CNTN4Q8IWV2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms