Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVE0

CROCCP3, Putative ciliary rootlet coiled-coil protein-like 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROCCP3Q8IVE0 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CROCCP3Q8IVE0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CROCCP3Q8IVE0 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CROCCP3Q8IVE0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CROCCP3Q8IVE0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CROCCP3Q8IVE0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CROCCP3Q8IVE0 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CROCCP3Q8IVE0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CROCCP3Q8IVE0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CROCCP3Q8IVE0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CROCCP3Q8IVE0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CROCCP3Q8IVE0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CROCCP3Q8IVE0 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CROCCP3Q8IVE0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CROCCP3Q8IVE0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CROCCP3Q8IVE0 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CROCCP3Q8IVE0 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CROCCP3Q8IVE0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CROCCP3Q8IVE0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CROCCP3Q8IVE0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CROCCP3Q8IVE0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CROCCP3Q8IVE0 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CROCCP3Q8IVE0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CROCCP3Q8IVE0 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CROCCP3Q8IVE0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CROCCP3Q8IVE0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CROCCP3Q8IVE0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CROCCP3Q8IVE0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CROCCP3Q8IVE0 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CROCCP3Q8IVE0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CROCCP3Q8IVE0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CROCCP3Q8IVE0 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CROCCP3Q8IVE0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CROCCP3Q8IVE0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CROCCP3Q8IVE0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CROCCP3Q8IVE0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CROCCP3Q8IVE0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CROCCP3Q8IVE0 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CROCCP3Q8IVE0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CROCCP3Q8IVE0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CROCCP3Q8IVE0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CROCCP3Q8IVE0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CROCCP3Q8IVE0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CROCCP3Q8IVE0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CROCCP3Q8IVE0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CROCCP3Q8IVE0 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CROCCP3Q8IVE0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CROCCP3Q8IVE0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CROCCP3Q8IVE0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CROCCP3Q8IVE0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CROCCP3Q8IVE0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CROCCP3Q8IVE0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CROCCP3Q8IVE0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CROCCP3Q8IVE0 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CROCCP3Q8IVE0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CROCCP3Q8IVE0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CROCCP3Q8IVE0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CROCCP3Q8IVE0 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CROCCP3Q8IVE0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CROCCP3Q8IVE0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CROCCP3Q8IVE0 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CROCCP3Q8IVE0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CROCCP3Q8IVE0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CROCCP3Q8IVE0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CROCCP3Q8IVE0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CROCCP3Q8IVE0 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CROCCP3Q8IVE0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CROCCP3Q8IVE0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CROCCP3Q8IVE0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CROCCP3Q8IVE0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CROCCP3Q8IVE0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CROCCP3Q8IVE0 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CROCCP3Q8IVE0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CROCCP3Q8IVE0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CROCCP3Q8IVE0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CROCCP3Q8IVE0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CROCCP3Q8IVE0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CROCCP3Q8IVE0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CROCCP3Q8IVE0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CROCCP3Q8IVE0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CROCCP3Q8IVE0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CROCCP3Q8IVE0 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CROCCP3Q8IVE0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CROCCP3Q8IVE0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CROCCP3Q8IVE0 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CROCCP3Q8IVE0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CROCCP3Q8IVE0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CROCCP3Q8IVE0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CROCCP3Q8IVE0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CROCCP3Q8IVE0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CROCCP3Q8IVE0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CROCCP3Q8IVE0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CROCCP3Q8IVE0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CROCCP3Q8IVE0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CROCCP3Q8IVE0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CROCCP3Q8IVE0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CROCCP3Q8IVE0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CROCCP3Q8IVE0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CROCCP3Q8IVE0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CROCCP3Q8IVE0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.9 ms