Protein–RNA interactions for Protein: Q86YW5

TREML1, Trem-like transcript 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML1Q86YW5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TREML1Q86YW5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TREML1Q86YW5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TREML1Q86YW5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TREML1Q86YW5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TREML1Q86YW5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TREML1Q86YW5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TREML1Q86YW5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TREML1Q86YW5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TREML1Q86YW5 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TREML1Q86YW5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TREML1Q86YW5 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TREML1Q86YW5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TREML1Q86YW5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TREML1Q86YW5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TREML1Q86YW5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TREML1Q86YW5 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TREML1Q86YW5 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TREML1Q86YW5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TREML1Q86YW5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
TREML1Q86YW5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TREML1Q86YW5 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TREML1Q86YW5 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TREML1Q86YW5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TREML1Q86YW5 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TREML1Q86YW5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TREML1Q86YW5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TREML1Q86YW5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TREML1Q86YW5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TREML1Q86YW5 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TREML1Q86YW5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TREML1Q86YW5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TREML1Q86YW5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TREML1Q86YW5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TREML1Q86YW5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TREML1Q86YW5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TREML1Q86YW5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TREML1Q86YW5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TREML1Q86YW5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TREML1Q86YW5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TREML1Q86YW5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TREML1Q86YW5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TREML1Q86YW5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TREML1Q86YW5 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TREML1Q86YW5 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TREML1Q86YW5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TREML1Q86YW5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TREML1Q86YW5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TREML1Q86YW5 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TREML1Q86YW5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
TREML1Q86YW5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TREML1Q86YW5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TREML1Q86YW5 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TREML1Q86YW5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TREML1Q86YW5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TREML1Q86YW5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TREML1Q86YW5 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TREML1Q86YW5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TREML1Q86YW5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TREML1Q86YW5 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TREML1Q86YW5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TREML1Q86YW5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TREML1Q86YW5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TREML1Q86YW5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TREML1Q86YW5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TREML1Q86YW5 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TREML1Q86YW5 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
TREML1Q86YW5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TREML1Q86YW5 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TREML1Q86YW5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TREML1Q86YW5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TREML1Q86YW5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TREML1Q86YW5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TREML1Q86YW5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TREML1Q86YW5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TREML1Q86YW5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TREML1Q86YW5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TREML1Q86YW5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TREML1Q86YW5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TREML1Q86YW5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TREML1Q86YW5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TREML1Q86YW5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TREML1Q86YW5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TREML1Q86YW5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TREML1Q86YW5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TREML1Q86YW5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TREML1Q86YW5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TREML1Q86YW5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TREML1Q86YW5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TREML1Q86YW5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TREML1Q86YW5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TREML1Q86YW5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TREML1Q86YW5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
TREML1Q86YW5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TREML1Q86YW5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
TREML1Q86YW5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TREML1Q86YW5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TREML1Q86YW5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TREML1Q86YW5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TREML1Q86YW5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms