Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
SKAP1Q86WV1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
SKAP1Q86WV1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
SKAP1Q86WV1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
SKAP1Q86WV1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
SKAP1Q86WV1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
SKAP1Q86WV1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
SKAP1Q86WV1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
SKAP1Q86WV1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
SKAP1Q86WV1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
SKAP1Q86WV1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
SKAP1Q86WV1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
SKAP1Q86WV1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC34.82■■■■□ 3.16
SKAP1Q86WV1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
SKAP1Q86WV1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
SKAP1Q86WV1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
SKAP1Q86WV1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
SKAP1Q86WV1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
SKAP1Q86WV1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC34.78■■■■□ 3.16
SKAP1Q86WV1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
SKAP1Q86WV1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
SKAP1Q86WV1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC34.77■■■■□ 3.16
SKAP1Q86WV1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
SKAP1Q86WV1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
SKAP1Q86WV1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
SKAP1Q86WV1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
SKAP1Q86WV1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC34.72■■■■□ 3.15
SKAP1Q86WV1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
SKAP1Q86WV1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
SKAP1Q86WV1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
SKAP1Q86WV1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
SKAP1Q86WV1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
SKAP1Q86WV1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
SKAP1Q86WV1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
SKAP1Q86WV1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
SKAP1Q86WV1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
SKAP1Q86WV1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
SKAP1Q86WV1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
SKAP1Q86WV1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
SKAP1Q86WV1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
SKAP1Q86WV1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
SKAP1Q86WV1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
SKAP1Q86WV1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
SKAP1Q86WV1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
SKAP1Q86WV1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
SKAP1Q86WV1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
SKAP1Q86WV1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
SKAP1Q86WV1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
SKAP1Q86WV1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
SKAP1Q86WV1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
SKAP1Q86WV1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
SKAP1Q86WV1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
SKAP1Q86WV1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
SKAP1Q86WV1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
SKAP1Q86WV1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
SKAP1Q86WV1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
SKAP1Q86WV1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
SKAP1Q86WV1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
SKAP1Q86WV1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
SKAP1Q86WV1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
SKAP1Q86WV1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
SKAP1Q86WV1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
SKAP1Q86WV1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
SKAP1Q86WV1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
SKAP1Q86WV1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
SKAP1Q86WV1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
SKAP1Q86WV1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
SKAP1Q86WV1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
SKAP1Q86WV1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
SKAP1Q86WV1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
SKAP1Q86WV1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
SKAP1Q86WV1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
SKAP1Q86WV1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
SKAP1Q86WV1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
SKAP1Q86WV1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
SKAP1Q86WV1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
SKAP1Q86WV1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
SKAP1Q86WV1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
SKAP1Q86WV1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
SKAP1Q86WV1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
SKAP1Q86WV1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
SKAP1Q86WV1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
SKAP1Q86WV1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
SKAP1Q86WV1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
SKAP1Q86WV1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
SKAP1Q86WV1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
SKAP1Q86WV1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
SKAP1Q86WV1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
SKAP1Q86WV1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
SKAP1Q86WV1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
SKAP1Q86WV1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
SKAP1Q86WV1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
SKAP1Q86WV1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
SKAP1Q86WV1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
SKAP1Q86WV1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
SKAP1Q86WV1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
SKAP1Q86WV1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
SKAP1Q86WV1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
SKAP1Q86WV1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
SKAP1Q86WV1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms