Protein–RNA interactions for Protein: Q86W92

PPFIBP1, Liprin-beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP1Q86W92 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
PPFIBP1Q86W92 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
PPFIBP1Q86W92 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
PPFIBP1Q86W92 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PPFIBP1Q86W92 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PPFIBP1Q86W92 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PPFIBP1Q86W92 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PPFIBP1Q86W92 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
PPFIBP1Q86W92 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
PPFIBP1Q86W92 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PPFIBP1Q86W92 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PPFIBP1Q86W92 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.89■■■□□ 2.53
PPFIBP1Q86W92 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PPFIBP1Q86W92 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
PPFIBP1Q86W92 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PPFIBP1Q86W92 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PPFIBP1Q86W92 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PPFIBP1Q86W92 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PPFIBP1Q86W92 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PPFIBP1Q86W92 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PPFIBP1Q86W92 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PPFIBP1Q86W92 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
PPFIBP1Q86W92 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PPFIBP1Q86W92 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PPFIBP1Q86W92 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PPFIBP1Q86W92 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PPFIBP1Q86W92 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PPFIBP1Q86W92 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PPFIBP1Q86W92 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PPFIBP1Q86W92 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
PPFIBP1Q86W92 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
PPFIBP1Q86W92 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
PPFIBP1Q86W92 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
PPFIBP1Q86W92 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PPFIBP1Q86W92 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PPFIBP1Q86W92 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PPFIBP1Q86W92 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PPFIBP1Q86W92 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PPFIBP1Q86W92 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PPFIBP1Q86W92 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PPFIBP1Q86W92 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PPFIBP1Q86W92 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PPFIBP1Q86W92 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
PPFIBP1Q86W92 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PPFIBP1Q86W92 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PPFIBP1Q86W92 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
PPFIBP1Q86W92 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
PPFIBP1Q86W92 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.67■■■□□ 2.5
PPFIBP1Q86W92 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PPFIBP1Q86W92 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PPFIBP1Q86W92 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PPFIBP1Q86W92 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PPFIBP1Q86W92 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
PPFIBP1Q86W92 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PPFIBP1Q86W92 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PPFIBP1Q86W92 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC30.6■■■□□ 2.49
PPFIBP1Q86W92 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PPFIBP1Q86W92 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
PPFIBP1Q86W92 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
PPFIBP1Q86W92 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PPFIBP1Q86W92 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PPFIBP1Q86W92 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PPFIBP1Q86W92 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PPFIBP1Q86W92 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PPFIBP1Q86W92 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PPFIBP1Q86W92 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
PPFIBP1Q86W92 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PPFIBP1Q86W92 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PPFIBP1Q86W92 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PPFIBP1Q86W92 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
PPFIBP1Q86W92 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PPFIBP1Q86W92 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PPFIBP1Q86W92 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PPFIBP1Q86W92 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
PPFIBP1Q86W92 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PPFIBP1Q86W92 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PPFIBP1Q86W92 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
PPFIBP1Q86W92 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PPFIBP1Q86W92 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PPFIBP1Q86W92 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PPFIBP1Q86W92 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PPFIBP1Q86W92 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PPFIBP1Q86W92 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PPFIBP1Q86W92 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
PPFIBP1Q86W92 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PPFIBP1Q86W92 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PPFIBP1Q86W92 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
PPFIBP1Q86W92 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PPFIBP1Q86W92 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PPFIBP1Q86W92 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PPFIBP1Q86W92 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PPFIBP1Q86W92 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PPFIBP1Q86W92 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PPFIBP1Q86W92 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PPFIBP1Q86W92 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PPFIBP1Q86W92 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PPFIBP1Q86W92 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PPFIBP1Q86W92 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PPFIBP1Q86W92 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PPFIBP1Q86W92 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms