Protein–RNA interactions for Protein: Q86W33

TPRA1, Transmembrane protein adipocyte-associated 1, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRA1Q86W33 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TPRA1Q86W33 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TPRA1Q86W33 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TPRA1Q86W33 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TPRA1Q86W33 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TPRA1Q86W33 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TPRA1Q86W33 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TPRA1Q86W33 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TPRA1Q86W33 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TPRA1Q86W33 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPRA1Q86W33 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPRA1Q86W33 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TPRA1Q86W33 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TPRA1Q86W33 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPRA1Q86W33 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TPRA1Q86W33 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TPRA1Q86W33 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TPRA1Q86W33 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TPRA1Q86W33 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TPRA1Q86W33 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TPRA1Q86W33 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TPRA1Q86W33 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TPRA1Q86W33 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TPRA1Q86W33 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TPRA1Q86W33 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TPRA1Q86W33 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TPRA1Q86W33 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TPRA1Q86W33 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TPRA1Q86W33 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TPRA1Q86W33 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TPRA1Q86W33 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TPRA1Q86W33 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TPRA1Q86W33 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TPRA1Q86W33 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TPRA1Q86W33 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TPRA1Q86W33 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TPRA1Q86W33 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TPRA1Q86W33 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TPRA1Q86W33 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TPRA1Q86W33 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TPRA1Q86W33 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TPRA1Q86W33 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TPRA1Q86W33 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TPRA1Q86W33 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TPRA1Q86W33 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TPRA1Q86W33 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TPRA1Q86W33 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TPRA1Q86W33 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TPRA1Q86W33 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TPRA1Q86W33 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TPRA1Q86W33 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TPRA1Q86W33 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TPRA1Q86W33 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TPRA1Q86W33 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TPRA1Q86W33 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TPRA1Q86W33 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TPRA1Q86W33 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TPRA1Q86W33 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TPRA1Q86W33 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TPRA1Q86W33 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TPRA1Q86W33 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TPRA1Q86W33 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TPRA1Q86W33 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TPRA1Q86W33 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TPRA1Q86W33 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TPRA1Q86W33 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TPRA1Q86W33 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TPRA1Q86W33 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TPRA1Q86W33 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TPRA1Q86W33 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TPRA1Q86W33 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TPRA1Q86W33 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TPRA1Q86W33 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TPRA1Q86W33 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TPRA1Q86W33 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TPRA1Q86W33 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TPRA1Q86W33 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TPRA1Q86W33 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TPRA1Q86W33 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TPRA1Q86W33 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TPRA1Q86W33 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TPRA1Q86W33 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TPRA1Q86W33 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TPRA1Q86W33 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TPRA1Q86W33 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TPRA1Q86W33 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TPRA1Q86W33 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TPRA1Q86W33 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TPRA1Q86W33 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TPRA1Q86W33 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TPRA1Q86W33 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TPRA1Q86W33 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TPRA1Q86W33 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TPRA1Q86W33 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TPRA1Q86W33 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TPRA1Q86W33 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TPRA1Q86W33 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TPRA1Q86W33 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TPRA1Q86W33 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TPRA1Q86W33 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms