Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z408

CSMD2, CUB and sushi domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSMD2Q7Z408 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CSMD2Q7Z408 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CSMD2Q7Z408 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSMD2Q7Z408 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSMD2Q7Z408 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSMD2Q7Z408 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSMD2Q7Z408 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CSMD2Q7Z408 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSMD2Q7Z408 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CSMD2Q7Z408 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSMD2Q7Z408 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSMD2Q7Z408 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSMD2Q7Z408 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSMD2Q7Z408 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSMD2Q7Z408 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSMD2Q7Z408 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSMD2Q7Z408 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSMD2Q7Z408 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSMD2Q7Z408 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSMD2Q7Z408 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSMD2Q7Z408 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSMD2Q7Z408 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSMD2Q7Z408 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSMD2Q7Z408 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSMD2Q7Z408 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSMD2Q7Z408 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSMD2Q7Z408 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSMD2Q7Z408 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CSMD2Q7Z408 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSMD2Q7Z408 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSMD2Q7Z408 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSMD2Q7Z408 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSMD2Q7Z408 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CSMD2Q7Z408 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSMD2Q7Z408 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CSMD2Q7Z408 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CSMD2Q7Z408 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CSMD2Q7Z408 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CSMD2Q7Z408 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSMD2Q7Z408 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSMD2Q7Z408 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSMD2Q7Z408 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSMD2Q7Z408 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSMD2Q7Z408 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSMD2Q7Z408 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CSMD2Q7Z408 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CSMD2Q7Z408 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CSMD2Q7Z408 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSMD2Q7Z408 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSMD2Q7Z408 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSMD2Q7Z408 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSMD2Q7Z408 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CSMD2Q7Z408 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSMD2Q7Z408 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSMD2Q7Z408 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSMD2Q7Z408 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CSMD2Q7Z408 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CSMD2Q7Z408 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CSMD2Q7Z408 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSMD2Q7Z408 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CSMD2Q7Z408 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CSMD2Q7Z408 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CSMD2Q7Z408 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CSMD2Q7Z408 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CSMD2Q7Z408 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSMD2Q7Z408 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSMD2Q7Z408 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CSMD2Q7Z408 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSMD2Q7Z408 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSMD2Q7Z408 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CSMD2Q7Z408 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CSMD2Q7Z408 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CSMD2Q7Z408 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CSMD2Q7Z408 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CSMD2Q7Z408 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CSMD2Q7Z408 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSMD2Q7Z408 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSMD2Q7Z408 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSMD2Q7Z408 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSMD2Q7Z408 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CSMD2Q7Z408 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CSMD2Q7Z408 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CSMD2Q7Z408 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CSMD2Q7Z408 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CSMD2Q7Z408 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CSMD2Q7Z408 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CSMD2Q7Z408 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CSMD2Q7Z408 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CSMD2Q7Z408 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CSMD2Q7Z408 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CSMD2Q7Z408 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CSMD2Q7Z408 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSMD2Q7Z408 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSMD2Q7Z408 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSMD2Q7Z408 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSMD2Q7Z408 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSMD2Q7Z408 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSMD2Q7Z408 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSMD2Q7Z408 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSMD2Q7Z408 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms