Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU0

TCF24, Transcription factor 24, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF24Q7RTU0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCF24Q7RTU0 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCF24Q7RTU0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCF24Q7RTU0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCF24Q7RTU0 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCF24Q7RTU0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCF24Q7RTU0 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCF24Q7RTU0 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCF24Q7RTU0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TCF24Q7RTU0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TCF24Q7RTU0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCF24Q7RTU0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TCF24Q7RTU0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCF24Q7RTU0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCF24Q7RTU0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCF24Q7RTU0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TCF24Q7RTU0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCF24Q7RTU0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCF24Q7RTU0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCF24Q7RTU0 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCF24Q7RTU0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCF24Q7RTU0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCF24Q7RTU0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCF24Q7RTU0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TCF24Q7RTU0 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TCF24Q7RTU0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TCF24Q7RTU0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TCF24Q7RTU0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TCF24Q7RTU0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TCF24Q7RTU0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TCF24Q7RTU0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TCF24Q7RTU0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TCF24Q7RTU0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TCF24Q7RTU0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TCF24Q7RTU0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TCF24Q7RTU0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TCF24Q7RTU0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TCF24Q7RTU0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TCF24Q7RTU0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TCF24Q7RTU0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TCF24Q7RTU0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TCF24Q7RTU0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TCF24Q7RTU0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TCF24Q7RTU0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TCF24Q7RTU0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.99
TCF24Q7RTU0 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TCF24Q7RTU0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TCF24Q7RTU0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TCF24Q7RTU0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TCF24Q7RTU0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TCF24Q7RTU0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TCF24Q7RTU0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TCF24Q7RTU0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TCF24Q7RTU0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TCF24Q7RTU0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TCF24Q7RTU0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TCF24Q7RTU0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TCF24Q7RTU0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TCF24Q7RTU0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TCF24Q7RTU0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TCF24Q7RTU0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TCF24Q7RTU0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TCF24Q7RTU0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TCF24Q7RTU0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TCF24Q7RTU0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TCF24Q7RTU0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TCF24Q7RTU0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TCF24Q7RTU0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TCF24Q7RTU0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TCF24Q7RTU0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TCF24Q7RTU0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TCF24Q7RTU0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TCF24Q7RTU0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TCF24Q7RTU0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TCF24Q7RTU0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TCF24Q7RTU0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TCF24Q7RTU0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TCF24Q7RTU0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TCF24Q7RTU0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TCF24Q7RTU0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TCF24Q7RTU0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TCF24Q7RTU0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TCF24Q7RTU0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TCF24Q7RTU0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TCF24Q7RTU0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TCF24Q7RTU0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TCF24Q7RTU0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TCF24Q7RTU0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TCF24Q7RTU0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TCF24Q7RTU0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TCF24Q7RTU0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TCF24Q7RTU0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TCF24Q7RTU0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TCF24Q7RTU0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TCF24Q7RTU0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TCF24Q7RTU0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TCF24Q7RTU0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TCF24Q7RTU0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TCF24Q7RTU0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TCF24Q7RTU0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms