Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZS17

RIPOR1, Rho family-interacting cell polarization regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPOR1Q6ZS17 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RIPOR1Q6ZS17 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RIPOR1Q6ZS17 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RIPOR1Q6ZS17 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RIPOR1Q6ZS17 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RIPOR1Q6ZS17 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RIPOR1Q6ZS17 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RIPOR1Q6ZS17 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RIPOR1Q6ZS17 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RIPOR1Q6ZS17 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RIPOR1Q6ZS17 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RIPOR1Q6ZS17 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RIPOR1Q6ZS17 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RIPOR1Q6ZS17 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RIPOR1Q6ZS17 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RIPOR1Q6ZS17 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RIPOR1Q6ZS17 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RIPOR1Q6ZS17 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RIPOR1Q6ZS17 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RIPOR1Q6ZS17 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RIPOR1Q6ZS17 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RIPOR1Q6ZS17 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RIPOR1Q6ZS17 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RIPOR1Q6ZS17 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RIPOR1Q6ZS17 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RIPOR1Q6ZS17 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RIPOR1Q6ZS17 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RIPOR1Q6ZS17 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RIPOR1Q6ZS17 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RIPOR1Q6ZS17 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RIPOR1Q6ZS17 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RIPOR1Q6ZS17 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RIPOR1Q6ZS17 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RIPOR1Q6ZS17 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
RIPOR1Q6ZS17 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RIPOR1Q6ZS17 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RIPOR1Q6ZS17 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RIPOR1Q6ZS17 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RIPOR1Q6ZS17 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RIPOR1Q6ZS17 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RIPOR1Q6ZS17 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RIPOR1Q6ZS17 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RIPOR1Q6ZS17 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RIPOR1Q6ZS17 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RIPOR1Q6ZS17 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RIPOR1Q6ZS17 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RIPOR1Q6ZS17 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RIPOR1Q6ZS17 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RIPOR1Q6ZS17 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RIPOR1Q6ZS17 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RIPOR1Q6ZS17 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RIPOR1Q6ZS17 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RIPOR1Q6ZS17 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
RIPOR1Q6ZS17 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RIPOR1Q6ZS17 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
RIPOR1Q6ZS17 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RIPOR1Q6ZS17 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RIPOR1Q6ZS17 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RIPOR1Q6ZS17 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RIPOR1Q6ZS17 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RIPOR1Q6ZS17 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
RIPOR1Q6ZS17 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RIPOR1Q6ZS17 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RIPOR1Q6ZS17 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RIPOR1Q6ZS17 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RIPOR1Q6ZS17 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RIPOR1Q6ZS17 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RIPOR1Q6ZS17 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RIPOR1Q6ZS17 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RIPOR1Q6ZS17 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RIPOR1Q6ZS17 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RIPOR1Q6ZS17 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RIPOR1Q6ZS17 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
RIPOR1Q6ZS17 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RIPOR1Q6ZS17 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RIPOR1Q6ZS17 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RIPOR1Q6ZS17 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RIPOR1Q6ZS17 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RIPOR1Q6ZS17 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RIPOR1Q6ZS17 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RIPOR1Q6ZS17 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RIPOR1Q6ZS17 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RIPOR1Q6ZS17 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RIPOR1Q6ZS17 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RIPOR1Q6ZS17 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RIPOR1Q6ZS17 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RIPOR1Q6ZS17 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RIPOR1Q6ZS17 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RIPOR1Q6ZS17 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RIPOR1Q6ZS17 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RIPOR1Q6ZS17 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RIPOR1Q6ZS17 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RIPOR1Q6ZS17 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
RIPOR1Q6ZS17 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RIPOR1Q6ZS17 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RIPOR1Q6ZS17 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RIPOR1Q6ZS17 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RIPOR1Q6ZS17 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RIPOR1Q6ZS17 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RIPOR1Q6ZS17 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms