Protein–RNA interactions for Protein: Q6W0C5

DPPA3, Developmental pluripotency-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DPPA3Q6W0C5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
DPPA3Q6W0C5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
DPPA3Q6W0C5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DPPA3Q6W0C5 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DPPA3Q6W0C5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DPPA3Q6W0C5 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DPPA3Q6W0C5 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DPPA3Q6W0C5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DPPA3Q6W0C5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DPPA3Q6W0C5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DPPA3Q6W0C5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DPPA3Q6W0C5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DPPA3Q6W0C5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DPPA3Q6W0C5 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DPPA3Q6W0C5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DPPA3Q6W0C5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DPPA3Q6W0C5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DPPA3Q6W0C5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DPPA3Q6W0C5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DPPA3Q6W0C5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DPPA3Q6W0C5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DPPA3Q6W0C5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DPPA3Q6W0C5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DPPA3Q6W0C5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DPPA3Q6W0C5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DPPA3Q6W0C5 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DPPA3Q6W0C5 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DPPA3Q6W0C5 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DPPA3Q6W0C5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DPPA3Q6W0C5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DPPA3Q6W0C5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DPPA3Q6W0C5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DPPA3Q6W0C5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DPPA3Q6W0C5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DPPA3Q6W0C5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DPPA3Q6W0C5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DPPA3Q6W0C5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DPPA3Q6W0C5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DPPA3Q6W0C5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
DPPA3Q6W0C5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DPPA3Q6W0C5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DPPA3Q6W0C5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DPPA3Q6W0C5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DPPA3Q6W0C5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DPPA3Q6W0C5 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DPPA3Q6W0C5 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DPPA3Q6W0C5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DPPA3Q6W0C5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DPPA3Q6W0C5 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DPPA3Q6W0C5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DPPA3Q6W0C5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DPPA3Q6W0C5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DPPA3Q6W0C5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DPPA3Q6W0C5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DPPA3Q6W0C5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DPPA3Q6W0C5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DPPA3Q6W0C5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DPPA3Q6W0C5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DPPA3Q6W0C5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DPPA3Q6W0C5 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DPPA3Q6W0C5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DPPA3Q6W0C5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DPPA3Q6W0C5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DPPA3Q6W0C5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DPPA3Q6W0C5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DPPA3Q6W0C5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
DPPA3Q6W0C5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DPPA3Q6W0C5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DPPA3Q6W0C5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DPPA3Q6W0C5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DPPA3Q6W0C5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DPPA3Q6W0C5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DPPA3Q6W0C5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DPPA3Q6W0C5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DPPA3Q6W0C5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
DPPA3Q6W0C5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DPPA3Q6W0C5 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DPPA3Q6W0C5 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DPPA3Q6W0C5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DPPA3Q6W0C5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DPPA3Q6W0C5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DPPA3Q6W0C5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DPPA3Q6W0C5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DPPA3Q6W0C5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DPPA3Q6W0C5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DPPA3Q6W0C5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DPPA3Q6W0C5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
DPPA3Q6W0C5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DPPA3Q6W0C5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DPPA3Q6W0C5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DPPA3Q6W0C5 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DPPA3Q6W0C5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DPPA3Q6W0C5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DPPA3Q6W0C5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DPPA3Q6W0C5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DPPA3Q6W0C5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DPPA3Q6W0C5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DPPA3Q6W0C5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DPPA3Q6W0C5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DPPA3Q6W0C5 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms