Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWU4

C6orf89, Bombesin receptor-activated protein C6orf89, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf89Q6UWU4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
C6orf89Q6UWU4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
C6orf89Q6UWU4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
C6orf89Q6UWU4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
C6orf89Q6UWU4 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
C6orf89Q6UWU4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
C6orf89Q6UWU4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
C6orf89Q6UWU4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
C6orf89Q6UWU4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
C6orf89Q6UWU4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
C6orf89Q6UWU4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
C6orf89Q6UWU4 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
C6orf89Q6UWU4 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
C6orf89Q6UWU4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
C6orf89Q6UWU4 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
C6orf89Q6UWU4 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
C6orf89Q6UWU4 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
C6orf89Q6UWU4 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
C6orf89Q6UWU4 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
C6orf89Q6UWU4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
C6orf89Q6UWU4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
C6orf89Q6UWU4 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
C6orf89Q6UWU4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
C6orf89Q6UWU4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
C6orf89Q6UWU4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
C6orf89Q6UWU4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
C6orf89Q6UWU4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
C6orf89Q6UWU4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
C6orf89Q6UWU4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
C6orf89Q6UWU4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
C6orf89Q6UWU4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
C6orf89Q6UWU4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
C6orf89Q6UWU4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
C6orf89Q6UWU4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
C6orf89Q6UWU4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
C6orf89Q6UWU4 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
C6orf89Q6UWU4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
C6orf89Q6UWU4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
C6orf89Q6UWU4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
C6orf89Q6UWU4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
C6orf89Q6UWU4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
C6orf89Q6UWU4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
C6orf89Q6UWU4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
C6orf89Q6UWU4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
C6orf89Q6UWU4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
C6orf89Q6UWU4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
C6orf89Q6UWU4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
C6orf89Q6UWU4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
C6orf89Q6UWU4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
C6orf89Q6UWU4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
C6orf89Q6UWU4 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
C6orf89Q6UWU4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
C6orf89Q6UWU4 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
C6orf89Q6UWU4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
C6orf89Q6UWU4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
C6orf89Q6UWU4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
C6orf89Q6UWU4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
C6orf89Q6UWU4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
C6orf89Q6UWU4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
C6orf89Q6UWU4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
C6orf89Q6UWU4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
C6orf89Q6UWU4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
C6orf89Q6UWU4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
C6orf89Q6UWU4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
C6orf89Q6UWU4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
C6orf89Q6UWU4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
C6orf89Q6UWU4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
C6orf89Q6UWU4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
C6orf89Q6UWU4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
C6orf89Q6UWU4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
C6orf89Q6UWU4 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
C6orf89Q6UWU4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
C6orf89Q6UWU4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
C6orf89Q6UWU4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
C6orf89Q6UWU4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
C6orf89Q6UWU4 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
C6orf89Q6UWU4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
C6orf89Q6UWU4 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
C6orf89Q6UWU4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
C6orf89Q6UWU4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
C6orf89Q6UWU4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
C6orf89Q6UWU4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
C6orf89Q6UWU4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
C6orf89Q6UWU4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
C6orf89Q6UWU4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
C6orf89Q6UWU4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
C6orf89Q6UWU4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
C6orf89Q6UWU4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
C6orf89Q6UWU4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
C6orf89Q6UWU4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
C6orf89Q6UWU4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
C6orf89Q6UWU4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
C6orf89Q6UWU4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
C6orf89Q6UWU4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
C6orf89Q6UWU4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
C6orf89Q6UWU4 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
C6orf89Q6UWU4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
C6orf89Q6UWU4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
C6orf89Q6UWU4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
C6orf89Q6UWU4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms