Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW10

SFTA2, Surfactant-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTA2Q6UW10 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SFTA2Q6UW10 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SFTA2Q6UW10 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SFTA2Q6UW10 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SFTA2Q6UW10 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SFTA2Q6UW10 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SFTA2Q6UW10 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SFTA2Q6UW10 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SFTA2Q6UW10 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SFTA2Q6UW10 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SFTA2Q6UW10 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SFTA2Q6UW10 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SFTA2Q6UW10 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SFTA2Q6UW10 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFTA2Q6UW10 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFTA2Q6UW10 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFTA2Q6UW10 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SFTA2Q6UW10 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SFTA2Q6UW10 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFTA2Q6UW10 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFTA2Q6UW10 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SFTA2Q6UW10 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SFTA2Q6UW10 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SFTA2Q6UW10 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SFTA2Q6UW10 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SFTA2Q6UW10 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SFTA2Q6UW10 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SFTA2Q6UW10 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SFTA2Q6UW10 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SFTA2Q6UW10 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFTA2Q6UW10 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFTA2Q6UW10 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SFTA2Q6UW10 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SFTA2Q6UW10 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFTA2Q6UW10 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFTA2Q6UW10 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFTA2Q6UW10 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFTA2Q6UW10 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFTA2Q6UW10 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFTA2Q6UW10 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SFTA2Q6UW10 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SFTA2Q6UW10 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFTA2Q6UW10 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SFTA2Q6UW10 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SFTA2Q6UW10 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFTA2Q6UW10 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFTA2Q6UW10 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SFTA2Q6UW10 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SFTA2Q6UW10 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SFTA2Q6UW10 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SFTA2Q6UW10 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SFTA2Q6UW10 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SFTA2Q6UW10 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SFTA2Q6UW10 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SFTA2Q6UW10 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SFTA2Q6UW10 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SFTA2Q6UW10 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SFTA2Q6UW10 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SFTA2Q6UW10 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SFTA2Q6UW10 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SFTA2Q6UW10 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SFTA2Q6UW10 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SFTA2Q6UW10 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SFTA2Q6UW10 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SFTA2Q6UW10 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SFTA2Q6UW10 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SFTA2Q6UW10 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SFTA2Q6UW10 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SFTA2Q6UW10 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SFTA2Q6UW10 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SFTA2Q6UW10 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SFTA2Q6UW10 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFTA2Q6UW10 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFTA2Q6UW10 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFTA2Q6UW10 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SFTA2Q6UW10 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SFTA2Q6UW10 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SFTA2Q6UW10 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SFTA2Q6UW10 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFTA2Q6UW10 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFTA2Q6UW10 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SFTA2Q6UW10 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SFTA2Q6UW10 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SFTA2Q6UW10 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SFTA2Q6UW10 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SFTA2Q6UW10 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SFTA2Q6UW10 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SFTA2Q6UW10 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SFTA2Q6UW10 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SFTA2Q6UW10 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SFTA2Q6UW10 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SFTA2Q6UW10 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SFTA2Q6UW10 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SFTA2Q6UW10 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SFTA2Q6UW10 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SFTA2Q6UW10 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SFTA2Q6UW10 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SFTA2Q6UW10 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SFTA2Q6UW10 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SFTA2Q6UW10 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms