Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCD5

RFWD3, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFWD3Q6PCD5 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RFWD3Q6PCD5 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RFWD3Q6PCD5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RFWD3Q6PCD5 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RFWD3Q6PCD5 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RFWD3Q6PCD5 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RFWD3Q6PCD5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RFWD3Q6PCD5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RFWD3Q6PCD5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RFWD3Q6PCD5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RFWD3Q6PCD5 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RFWD3Q6PCD5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RFWD3Q6PCD5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RFWD3Q6PCD5 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RFWD3Q6PCD5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RFWD3Q6PCD5 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RFWD3Q6PCD5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
RFWD3Q6PCD5 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RFWD3Q6PCD5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RFWD3Q6PCD5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RFWD3Q6PCD5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RFWD3Q6PCD5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RFWD3Q6PCD5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RFWD3Q6PCD5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RFWD3Q6PCD5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RFWD3Q6PCD5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RFWD3Q6PCD5 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RFWD3Q6PCD5 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RFWD3Q6PCD5 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RFWD3Q6PCD5 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RFWD3Q6PCD5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
RFWD3Q6PCD5 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RFWD3Q6PCD5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
RFWD3Q6PCD5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
RFWD3Q6PCD5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
RFWD3Q6PCD5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RFWD3Q6PCD5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RFWD3Q6PCD5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RFWD3Q6PCD5 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RFWD3Q6PCD5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RFWD3Q6PCD5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RFWD3Q6PCD5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RFWD3Q6PCD5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RFWD3Q6PCD5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RFWD3Q6PCD5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RFWD3Q6PCD5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RFWD3Q6PCD5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RFWD3Q6PCD5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RFWD3Q6PCD5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RFWD3Q6PCD5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RFWD3Q6PCD5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
RFWD3Q6PCD5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RFWD3Q6PCD5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RFWD3Q6PCD5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RFWD3Q6PCD5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RFWD3Q6PCD5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RFWD3Q6PCD5 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RFWD3Q6PCD5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RFWD3Q6PCD5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RFWD3Q6PCD5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RFWD3Q6PCD5 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RFWD3Q6PCD5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RFWD3Q6PCD5 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RFWD3Q6PCD5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RFWD3Q6PCD5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RFWD3Q6PCD5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RFWD3Q6PCD5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RFWD3Q6PCD5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RFWD3Q6PCD5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RFWD3Q6PCD5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RFWD3Q6PCD5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RFWD3Q6PCD5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
RFWD3Q6PCD5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
RFWD3Q6PCD5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RFWD3Q6PCD5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RFWD3Q6PCD5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RFWD3Q6PCD5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RFWD3Q6PCD5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RFWD3Q6PCD5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RFWD3Q6PCD5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RFWD3Q6PCD5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RFWD3Q6PCD5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RFWD3Q6PCD5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RFWD3Q6PCD5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RFWD3Q6PCD5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RFWD3Q6PCD5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RFWD3Q6PCD5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RFWD3Q6PCD5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RFWD3Q6PCD5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RFWD3Q6PCD5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
RFWD3Q6PCD5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RFWD3Q6PCD5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RFWD3Q6PCD5 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RFWD3Q6PCD5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RFWD3Q6PCD5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RFWD3Q6PCD5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RFWD3Q6PCD5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RFWD3Q6PCD5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RFWD3Q6PCD5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RFWD3Q6PCD5 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms