Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSX1

CCDC70, Coiled-coil domain-containing protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC70Q6NSX1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC70Q6NSX1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC70Q6NSX1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC70Q6NSX1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC70Q6NSX1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC70Q6NSX1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC70Q6NSX1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC70Q6NSX1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC70Q6NSX1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC70Q6NSX1 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC70Q6NSX1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC70Q6NSX1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC70Q6NSX1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC70Q6NSX1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC70Q6NSX1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC70Q6NSX1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC70Q6NSX1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC70Q6NSX1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC70Q6NSX1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC70Q6NSX1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC70Q6NSX1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC70Q6NSX1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC70Q6NSX1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC70Q6NSX1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC70Q6NSX1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC70Q6NSX1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC70Q6NSX1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC70Q6NSX1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC70Q6NSX1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC70Q6NSX1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC70Q6NSX1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC70Q6NSX1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC70Q6NSX1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
CCDC70Q6NSX1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC70Q6NSX1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC70Q6NSX1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC70Q6NSX1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC70Q6NSX1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC70Q6NSX1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC70Q6NSX1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC70Q6NSX1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC70Q6NSX1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC70Q6NSX1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC70Q6NSX1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC70Q6NSX1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC70Q6NSX1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC70Q6NSX1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC70Q6NSX1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC70Q6NSX1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC70Q6NSX1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC70Q6NSX1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC70Q6NSX1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC70Q6NSX1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC70Q6NSX1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC70Q6NSX1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC70Q6NSX1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC70Q6NSX1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC70Q6NSX1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC70Q6NSX1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC70Q6NSX1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC70Q6NSX1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC70Q6NSX1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC70Q6NSX1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC70Q6NSX1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC70Q6NSX1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC70Q6NSX1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC70Q6NSX1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC70Q6NSX1 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC70Q6NSX1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC70Q6NSX1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC70Q6NSX1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC70Q6NSX1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC70Q6NSX1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC70Q6NSX1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC70Q6NSX1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CCDC70Q6NSX1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC70Q6NSX1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC70Q6NSX1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC70Q6NSX1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC70Q6NSX1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC70Q6NSX1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC70Q6NSX1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC70Q6NSX1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC70Q6NSX1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC70Q6NSX1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC70Q6NSX1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC70Q6NSX1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC70Q6NSX1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC70Q6NSX1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CCDC70Q6NSX1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC70Q6NSX1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC70Q6NSX1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC70Q6NSX1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC70Q6NSX1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC70Q6NSX1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC70Q6NSX1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC70Q6NSX1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC70Q6NSX1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC70Q6NSX1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC70Q6NSX1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms