Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSX1

CCDC70, Coiled-coil domain-containing protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC70Q6NSX1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC70Q6NSX1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC70Q6NSX1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC70Q6NSX1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC70Q6NSX1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC70Q6NSX1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC70Q6NSX1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC70Q6NSX1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC70Q6NSX1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC70Q6NSX1 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC70Q6NSX1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC70Q6NSX1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC70Q6NSX1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC70Q6NSX1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC70Q6NSX1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC70Q6NSX1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC70Q6NSX1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC70Q6NSX1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC70Q6NSX1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC70Q6NSX1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC70Q6NSX1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC70Q6NSX1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC70Q6NSX1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC70Q6NSX1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC70Q6NSX1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC70Q6NSX1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC70Q6NSX1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC70Q6NSX1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC70Q6NSX1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC70Q6NSX1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC70Q6NSX1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC70Q6NSX1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC70Q6NSX1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
CCDC70Q6NSX1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC70Q6NSX1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC70Q6NSX1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC70Q6NSX1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC70Q6NSX1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC70Q6NSX1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC70Q6NSX1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC70Q6NSX1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC70Q6NSX1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC70Q6NSX1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC70Q6NSX1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC70Q6NSX1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC70Q6NSX1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC70Q6NSX1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC70Q6NSX1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC70Q6NSX1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC70Q6NSX1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC70Q6NSX1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC70Q6NSX1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC70Q6NSX1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC70Q6NSX1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC70Q6NSX1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC70Q6NSX1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC70Q6NSX1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC70Q6NSX1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC70Q6NSX1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC70Q6NSX1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC70Q6NSX1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC70Q6NSX1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC70Q6NSX1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC70Q6NSX1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC70Q6NSX1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC70Q6NSX1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC70Q6NSX1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC70Q6NSX1 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC70Q6NSX1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC70Q6NSX1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC70Q6NSX1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC70Q6NSX1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC70Q6NSX1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC70Q6NSX1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC70Q6NSX1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CCDC70Q6NSX1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC70Q6NSX1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC70Q6NSX1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC70Q6NSX1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC70Q6NSX1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC70Q6NSX1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC70Q6NSX1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC70Q6NSX1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC70Q6NSX1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC70Q6NSX1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC70Q6NSX1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC70Q6NSX1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC70Q6NSX1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC70Q6NSX1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CCDC70Q6NSX1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC70Q6NSX1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC70Q6NSX1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC70Q6NSX1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC70Q6NSX1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC70Q6NSX1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC70Q6NSX1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC70Q6NSX1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC70Q6NSX1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC70Q6NSX1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC70Q6NSX1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms