Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC8EQ6NSJ5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC8EQ6NSJ5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRC8EQ6NSJ5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRRC8EQ6NSJ5 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRC8EQ6NSJ5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC8EQ6NSJ5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRC8EQ6NSJ5 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRC8EQ6NSJ5 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRC8EQ6NSJ5 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
LRRC8EQ6NSJ5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LRRC8EQ6NSJ5 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
LRRC8EQ6NSJ5 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LRRC8EQ6NSJ5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LRRC8EQ6NSJ5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LRRC8EQ6NSJ5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.55■■■□□ 2
LRRC8EQ6NSJ5 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.55■■■□□ 2
LRRC8EQ6NSJ5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LRRC8EQ6NSJ5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
LRRC8EQ6NSJ5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
LRRC8EQ6NSJ5 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LRRC8EQ6NSJ5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
LRRC8EQ6NSJ5 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC8EQ6NSJ5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRC8EQ6NSJ5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRC8EQ6NSJ5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRC8EQ6NSJ5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRC8EQ6NSJ5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC8EQ6NSJ5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC8EQ6NSJ5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRRC8EQ6NSJ5 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRRC8EQ6NSJ5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRRC8EQ6NSJ5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRRC8EQ6NSJ5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRRC8EQ6NSJ5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LRRC8EQ6NSJ5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LRRC8EQ6NSJ5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRC8EQ6NSJ5 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRC8EQ6NSJ5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRC8EQ6NSJ5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRC8EQ6NSJ5 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRC8EQ6NSJ5 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRC8EQ6NSJ5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRC8EQ6NSJ5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRC8EQ6NSJ5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRC8EQ6NSJ5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRC8EQ6NSJ5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRC8EQ6NSJ5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRC8EQ6NSJ5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRC8EQ6NSJ5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRC8EQ6NSJ5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRC8EQ6NSJ5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRC8EQ6NSJ5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRC8EQ6NSJ5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRC8EQ6NSJ5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRC8EQ6NSJ5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRRC8EQ6NSJ5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
LRRC8EQ6NSJ5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRRC8EQ6NSJ5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRRC8EQ6NSJ5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRRC8EQ6NSJ5 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRC8EQ6NSJ5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRC8EQ6NSJ5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRC8EQ6NSJ5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRC8EQ6NSJ5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRC8EQ6NSJ5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRC8EQ6NSJ5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRC8EQ6NSJ5 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRC8EQ6NSJ5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRC8EQ6NSJ5 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LRRC8EQ6NSJ5 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LRRC8EQ6NSJ5 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRC8EQ6NSJ5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRC8EQ6NSJ5 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRC8EQ6NSJ5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRC8EQ6NSJ5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRC8EQ6NSJ5 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRC8EQ6NSJ5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRC8EQ6NSJ5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRRC8EQ6NSJ5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRRC8EQ6NSJ5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRRC8EQ6NSJ5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRC8EQ6NSJ5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRC8EQ6NSJ5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRC8EQ6NSJ5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRC8EQ6NSJ5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRC8EQ6NSJ5 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRC8EQ6NSJ5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRC8EQ6NSJ5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRC8EQ6NSJ5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRC8EQ6NSJ5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRRC8EQ6NSJ5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRC8EQ6NSJ5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRC8EQ6NSJ5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRC8EQ6NSJ5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRC8EQ6NSJ5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRC8EQ6NSJ5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRC8EQ6NSJ5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms