Protein–RNA interactions for Protein: Q6IEE8

SLFN12L, Schlafen family member 12-like, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN12LQ6IEE8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SLFN12LQ6IEE8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SLFN12LQ6IEE8 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SLFN12LQ6IEE8 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SLFN12LQ6IEE8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SLFN12LQ6IEE8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SLFN12LQ6IEE8 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SLFN12LQ6IEE8 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SLFN12LQ6IEE8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SLFN12LQ6IEE8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
SLFN12LQ6IEE8 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SLFN12LQ6IEE8 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SLFN12LQ6IEE8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
SLFN12LQ6IEE8 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SLFN12LQ6IEE8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SLFN12LQ6IEE8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SLFN12LQ6IEE8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SLFN12LQ6IEE8 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SLFN12LQ6IEE8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SLFN12LQ6IEE8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SLFN12LQ6IEE8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SLFN12LQ6IEE8 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SLFN12LQ6IEE8 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SLFN12LQ6IEE8 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SLFN12LQ6IEE8 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SLFN12LQ6IEE8 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
SLFN12LQ6IEE8 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.42
SLFN12LQ6IEE8 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
SLFN12LQ6IEE8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SLFN12LQ6IEE8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SLFN12LQ6IEE8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SLFN12LQ6IEE8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SLFN12LQ6IEE8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SLFN12LQ6IEE8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
SLFN12LQ6IEE8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SLFN12LQ6IEE8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SLFN12LQ6IEE8 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
SLFN12LQ6IEE8 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SLFN12LQ6IEE8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SLFN12LQ6IEE8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SLFN12LQ6IEE8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SLFN12LQ6IEE8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SLFN12LQ6IEE8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SLFN12LQ6IEE8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SLFN12LQ6IEE8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SLFN12LQ6IEE8 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SLFN12LQ6IEE8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
SLFN12LQ6IEE8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SLFN12LQ6IEE8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SLFN12LQ6IEE8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
SLFN12LQ6IEE8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SLFN12LQ6IEE8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SLFN12LQ6IEE8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SLFN12LQ6IEE8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SLFN12LQ6IEE8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
SLFN12LQ6IEE8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SLFN12LQ6IEE8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SLFN12LQ6IEE8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SLFN12LQ6IEE8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SLFN12LQ6IEE8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SLFN12LQ6IEE8 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SLFN12LQ6IEE8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SLFN12LQ6IEE8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
SLFN12LQ6IEE8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SLFN12LQ6IEE8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SLFN12LQ6IEE8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SLFN12LQ6IEE8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SLFN12LQ6IEE8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SLFN12LQ6IEE8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SLFN12LQ6IEE8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SLFN12LQ6IEE8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SLFN12LQ6IEE8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
SLFN12LQ6IEE8 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SLFN12LQ6IEE8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SLFN12LQ6IEE8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SLFN12LQ6IEE8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SLFN12LQ6IEE8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SLFN12LQ6IEE8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SLFN12LQ6IEE8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SLFN12LQ6IEE8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SLFN12LQ6IEE8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SLFN12LQ6IEE8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SLFN12LQ6IEE8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SLFN12LQ6IEE8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SLFN12LQ6IEE8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SLFN12LQ6IEE8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SLFN12LQ6IEE8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SLFN12LQ6IEE8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SLFN12LQ6IEE8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SLFN12LQ6IEE8 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SLFN12LQ6IEE8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SLFN12LQ6IEE8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
SLFN12LQ6IEE8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
SLFN12LQ6IEE8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SLFN12LQ6IEE8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SLFN12LQ6IEE8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
SLFN12LQ6IEE8 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SLFN12LQ6IEE8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SLFN12LQ6IEE8 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SLFN12LQ6IEE8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms