Protein–RNA interactions for Protein: Q68CR1

SEL1L3, Protein sel-1 homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEL1L3Q68CR1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SEL1L3Q68CR1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SEL1L3Q68CR1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SEL1L3Q68CR1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
SEL1L3Q68CR1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SEL1L3Q68CR1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SEL1L3Q68CR1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SEL1L3Q68CR1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SEL1L3Q68CR1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SEL1L3Q68CR1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SEL1L3Q68CR1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SEL1L3Q68CR1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SEL1L3Q68CR1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SEL1L3Q68CR1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SEL1L3Q68CR1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SEL1L3Q68CR1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SEL1L3Q68CR1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SEL1L3Q68CR1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SEL1L3Q68CR1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SEL1L3Q68CR1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SEL1L3Q68CR1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SEL1L3Q68CR1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SEL1L3Q68CR1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SEL1L3Q68CR1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SEL1L3Q68CR1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SEL1L3Q68CR1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SEL1L3Q68CR1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SEL1L3Q68CR1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SEL1L3Q68CR1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SEL1L3Q68CR1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SEL1L3Q68CR1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SEL1L3Q68CR1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SEL1L3Q68CR1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SEL1L3Q68CR1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SEL1L3Q68CR1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SEL1L3Q68CR1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SEL1L3Q68CR1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SEL1L3Q68CR1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SEL1L3Q68CR1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SEL1L3Q68CR1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SEL1L3Q68CR1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SEL1L3Q68CR1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SEL1L3Q68CR1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SEL1L3Q68CR1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SEL1L3Q68CR1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SEL1L3Q68CR1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SEL1L3Q68CR1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SEL1L3Q68CR1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SEL1L3Q68CR1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SEL1L3Q68CR1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SEL1L3Q68CR1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SEL1L3Q68CR1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SEL1L3Q68CR1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SEL1L3Q68CR1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SEL1L3Q68CR1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SEL1L3Q68CR1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SEL1L3Q68CR1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SEL1L3Q68CR1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SEL1L3Q68CR1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SEL1L3Q68CR1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SEL1L3Q68CR1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SEL1L3Q68CR1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SEL1L3Q68CR1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SEL1L3Q68CR1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SEL1L3Q68CR1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SEL1L3Q68CR1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SEL1L3Q68CR1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SEL1L3Q68CR1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SEL1L3Q68CR1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SEL1L3Q68CR1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
SEL1L3Q68CR1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SEL1L3Q68CR1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SEL1L3Q68CR1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SEL1L3Q68CR1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SEL1L3Q68CR1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SEL1L3Q68CR1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SEL1L3Q68CR1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SEL1L3Q68CR1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SEL1L3Q68CR1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SEL1L3Q68CR1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SEL1L3Q68CR1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SEL1L3Q68CR1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SEL1L3Q68CR1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SEL1L3Q68CR1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SEL1L3Q68CR1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SEL1L3Q68CR1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SEL1L3Q68CR1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SEL1L3Q68CR1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SEL1L3Q68CR1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SEL1L3Q68CR1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SEL1L3Q68CR1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SEL1L3Q68CR1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SEL1L3Q68CR1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SEL1L3Q68CR1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SEL1L3Q68CR1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SEL1L3Q68CR1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SEL1L3Q68CR1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SEL1L3Q68CR1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SEL1L3Q68CR1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SEL1L3Q68CR1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms