Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYJ5

MALRD1, MAM and LDL-receptor class A domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALRD1Q5VYJ5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
MALRD1Q5VYJ5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MALRD1Q5VYJ5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MALRD1Q5VYJ5 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MALRD1Q5VYJ5 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MALRD1Q5VYJ5 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MALRD1Q5VYJ5 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MALRD1Q5VYJ5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MALRD1Q5VYJ5 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MALRD1Q5VYJ5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MALRD1Q5VYJ5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MALRD1Q5VYJ5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MALRD1Q5VYJ5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MALRD1Q5VYJ5 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MALRD1Q5VYJ5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MALRD1Q5VYJ5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MALRD1Q5VYJ5 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MALRD1Q5VYJ5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
MALRD1Q5VYJ5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MALRD1Q5VYJ5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MALRD1Q5VYJ5 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MALRD1Q5VYJ5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MALRD1Q5VYJ5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MALRD1Q5VYJ5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MALRD1Q5VYJ5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MALRD1Q5VYJ5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MALRD1Q5VYJ5 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MALRD1Q5VYJ5 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MALRD1Q5VYJ5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MALRD1Q5VYJ5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MALRD1Q5VYJ5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MALRD1Q5VYJ5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MALRD1Q5VYJ5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MALRD1Q5VYJ5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MALRD1Q5VYJ5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MALRD1Q5VYJ5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MALRD1Q5VYJ5 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MALRD1Q5VYJ5 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MALRD1Q5VYJ5 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MALRD1Q5VYJ5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MALRD1Q5VYJ5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MALRD1Q5VYJ5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MALRD1Q5VYJ5 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MALRD1Q5VYJ5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MALRD1Q5VYJ5 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MALRD1Q5VYJ5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MALRD1Q5VYJ5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MALRD1Q5VYJ5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MALRD1Q5VYJ5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MALRD1Q5VYJ5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MALRD1Q5VYJ5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MALRD1Q5VYJ5 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MALRD1Q5VYJ5 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MALRD1Q5VYJ5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MALRD1Q5VYJ5 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MALRD1Q5VYJ5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MALRD1Q5VYJ5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MALRD1Q5VYJ5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MALRD1Q5VYJ5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MALRD1Q5VYJ5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MALRD1Q5VYJ5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MALRD1Q5VYJ5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MALRD1Q5VYJ5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MALRD1Q5VYJ5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
MALRD1Q5VYJ5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MALRD1Q5VYJ5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MALRD1Q5VYJ5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MALRD1Q5VYJ5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MALRD1Q5VYJ5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MALRD1Q5VYJ5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MALRD1Q5VYJ5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MALRD1Q5VYJ5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MALRD1Q5VYJ5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MALRD1Q5VYJ5 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MALRD1Q5VYJ5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MALRD1Q5VYJ5 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MALRD1Q5VYJ5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MALRD1Q5VYJ5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MALRD1Q5VYJ5 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MALRD1Q5VYJ5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MALRD1Q5VYJ5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MALRD1Q5VYJ5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MALRD1Q5VYJ5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MALRD1Q5VYJ5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MALRD1Q5VYJ5 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MALRD1Q5VYJ5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MALRD1Q5VYJ5 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MALRD1Q5VYJ5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MALRD1Q5VYJ5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MALRD1Q5VYJ5 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MALRD1Q5VYJ5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MALRD1Q5VYJ5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MALRD1Q5VYJ5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MALRD1Q5VYJ5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MALRD1Q5VYJ5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MALRD1Q5VYJ5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MALRD1Q5VYJ5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MALRD1Q5VYJ5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MALRD1Q5VYJ5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MALRD1Q5VYJ5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms