Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWQ0

RSBN1, Round spermatid basic protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSBN1Q5VWQ0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RSBN1Q5VWQ0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RSBN1Q5VWQ0 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RSBN1Q5VWQ0 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RSBN1Q5VWQ0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RSBN1Q5VWQ0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RSBN1Q5VWQ0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RSBN1Q5VWQ0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RSBN1Q5VWQ0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RSBN1Q5VWQ0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RSBN1Q5VWQ0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RSBN1Q5VWQ0 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RSBN1Q5VWQ0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RSBN1Q5VWQ0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RSBN1Q5VWQ0 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RSBN1Q5VWQ0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RSBN1Q5VWQ0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RSBN1Q5VWQ0 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RSBN1Q5VWQ0 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RSBN1Q5VWQ0 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RSBN1Q5VWQ0 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RSBN1Q5VWQ0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RSBN1Q5VWQ0 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RSBN1Q5VWQ0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RSBN1Q5VWQ0 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RSBN1Q5VWQ0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RSBN1Q5VWQ0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RSBN1Q5VWQ0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RSBN1Q5VWQ0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RSBN1Q5VWQ0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RSBN1Q5VWQ0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RSBN1Q5VWQ0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RSBN1Q5VWQ0 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RSBN1Q5VWQ0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RSBN1Q5VWQ0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RSBN1Q5VWQ0 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RSBN1Q5VWQ0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RSBN1Q5VWQ0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RSBN1Q5VWQ0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RSBN1Q5VWQ0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RSBN1Q5VWQ0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RSBN1Q5VWQ0 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RSBN1Q5VWQ0 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RSBN1Q5VWQ0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RSBN1Q5VWQ0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RSBN1Q5VWQ0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RSBN1Q5VWQ0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RSBN1Q5VWQ0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RSBN1Q5VWQ0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RSBN1Q5VWQ0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RSBN1Q5VWQ0 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RSBN1Q5VWQ0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RSBN1Q5VWQ0 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RSBN1Q5VWQ0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RSBN1Q5VWQ0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RSBN1Q5VWQ0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RSBN1Q5VWQ0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RSBN1Q5VWQ0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RSBN1Q5VWQ0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RSBN1Q5VWQ0 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RSBN1Q5VWQ0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RSBN1Q5VWQ0 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RSBN1Q5VWQ0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RSBN1Q5VWQ0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RSBN1Q5VWQ0 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RSBN1Q5VWQ0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RSBN1Q5VWQ0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RSBN1Q5VWQ0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RSBN1Q5VWQ0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RSBN1Q5VWQ0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RSBN1Q5VWQ0 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RSBN1Q5VWQ0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RSBN1Q5VWQ0 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RSBN1Q5VWQ0 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RSBN1Q5VWQ0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RSBN1Q5VWQ0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RSBN1Q5VWQ0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RSBN1Q5VWQ0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RSBN1Q5VWQ0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RSBN1Q5VWQ0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RSBN1Q5VWQ0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RSBN1Q5VWQ0 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RSBN1Q5VWQ0 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RSBN1Q5VWQ0 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RSBN1Q5VWQ0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RSBN1Q5VWQ0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RSBN1Q5VWQ0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RSBN1Q5VWQ0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RSBN1Q5VWQ0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RSBN1Q5VWQ0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RSBN1Q5VWQ0 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RSBN1Q5VWQ0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RSBN1Q5VWQ0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RSBN1Q5VWQ0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RSBN1Q5VWQ0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RSBN1Q5VWQ0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RSBN1Q5VWQ0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RSBN1Q5VWQ0 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RSBN1Q5VWQ0 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RSBN1Q5VWQ0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms