Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTQ0

TTC39B, Tetratricopeptide repeat protein 39B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC39BQ5VTQ0 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TTC39BQ5VTQ0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TTC39BQ5VTQ0 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TTC39BQ5VTQ0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TTC39BQ5VTQ0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TTC39BQ5VTQ0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
TTC39BQ5VTQ0 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TTC39BQ5VTQ0 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TTC39BQ5VTQ0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TTC39BQ5VTQ0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TTC39BQ5VTQ0 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TTC39BQ5VTQ0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TTC39BQ5VTQ0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TTC39BQ5VTQ0 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TTC39BQ5VTQ0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TTC39BQ5VTQ0 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TTC39BQ5VTQ0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TTC39BQ5VTQ0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TTC39BQ5VTQ0 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TTC39BQ5VTQ0 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TTC39BQ5VTQ0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TTC39BQ5VTQ0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TTC39BQ5VTQ0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TTC39BQ5VTQ0 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TTC39BQ5VTQ0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TTC39BQ5VTQ0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TTC39BQ5VTQ0 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TTC39BQ5VTQ0 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TTC39BQ5VTQ0 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TTC39BQ5VTQ0 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TTC39BQ5VTQ0 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TTC39BQ5VTQ0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
TTC39BQ5VTQ0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TTC39BQ5VTQ0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TTC39BQ5VTQ0 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TTC39BQ5VTQ0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TTC39BQ5VTQ0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TTC39BQ5VTQ0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TTC39BQ5VTQ0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TTC39BQ5VTQ0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TTC39BQ5VTQ0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TTC39BQ5VTQ0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TTC39BQ5VTQ0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TTC39BQ5VTQ0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TTC39BQ5VTQ0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TTC39BQ5VTQ0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TTC39BQ5VTQ0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TTC39BQ5VTQ0 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TTC39BQ5VTQ0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TTC39BQ5VTQ0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TTC39BQ5VTQ0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TTC39BQ5VTQ0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TTC39BQ5VTQ0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TTC39BQ5VTQ0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TTC39BQ5VTQ0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TTC39BQ5VTQ0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TTC39BQ5VTQ0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
TTC39BQ5VTQ0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TTC39BQ5VTQ0 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TTC39BQ5VTQ0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TTC39BQ5VTQ0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TTC39BQ5VTQ0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TTC39BQ5VTQ0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TTC39BQ5VTQ0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
TTC39BQ5VTQ0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TTC39BQ5VTQ0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TTC39BQ5VTQ0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TTC39BQ5VTQ0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
TTC39BQ5VTQ0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TTC39BQ5VTQ0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TTC39BQ5VTQ0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TTC39BQ5VTQ0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TTC39BQ5VTQ0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TTC39BQ5VTQ0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TTC39BQ5VTQ0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TTC39BQ5VTQ0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TTC39BQ5VTQ0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TTC39BQ5VTQ0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TTC39BQ5VTQ0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TTC39BQ5VTQ0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TTC39BQ5VTQ0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TTC39BQ5VTQ0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TTC39BQ5VTQ0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TTC39BQ5VTQ0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TTC39BQ5VTQ0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TTC39BQ5VTQ0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TTC39BQ5VTQ0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TTC39BQ5VTQ0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TTC39BQ5VTQ0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TTC39BQ5VTQ0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TTC39BQ5VTQ0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TTC39BQ5VTQ0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TTC39BQ5VTQ0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TTC39BQ5VTQ0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TTC39BQ5VTQ0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TTC39BQ5VTQ0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TTC39BQ5VTQ0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TTC39BQ5VTQ0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TTC39BQ5VTQ0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TTC39BQ5VTQ0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.8 ms