Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTE0

EEF1A1P5, Putative elongation factor 1-alpha-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1A1P5Q5VTE0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
EEF1A1P5Q5VTE0 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EEF1A1P5Q5VTE0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EEF1A1P5Q5VTE0 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EEF1A1P5Q5VTE0 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EEF1A1P5Q5VTE0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EEF1A1P5Q5VTE0 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EEF1A1P5Q5VTE0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EEF1A1P5Q5VTE0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EEF1A1P5Q5VTE0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EEF1A1P5Q5VTE0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EEF1A1P5Q5VTE0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
EEF1A1P5Q5VTE0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EEF1A1P5Q5VTE0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EEF1A1P5Q5VTE0 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EEF1A1P5Q5VTE0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EEF1A1P5Q5VTE0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EEF1A1P5Q5VTE0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EEF1A1P5Q5VTE0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EEF1A1P5Q5VTE0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EEF1A1P5Q5VTE0 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EEF1A1P5Q5VTE0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EEF1A1P5Q5VTE0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EEF1A1P5Q5VTE0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EEF1A1P5Q5VTE0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EEF1A1P5Q5VTE0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EEF1A1P5Q5VTE0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EEF1A1P5Q5VTE0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EEF1A1P5Q5VTE0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EEF1A1P5Q5VTE0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EEF1A1P5Q5VTE0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EEF1A1P5Q5VTE0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EEF1A1P5Q5VTE0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
EEF1A1P5Q5VTE0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EEF1A1P5Q5VTE0 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EEF1A1P5Q5VTE0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EEF1A1P5Q5VTE0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
EEF1A1P5Q5VTE0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EEF1A1P5Q5VTE0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EEF1A1P5Q5VTE0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EEF1A1P5Q5VTE0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EEF1A1P5Q5VTE0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EEF1A1P5Q5VTE0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
EEF1A1P5Q5VTE0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EEF1A1P5Q5VTE0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EEF1A1P5Q5VTE0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EEF1A1P5Q5VTE0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EEF1A1P5Q5VTE0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EEF1A1P5Q5VTE0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EEF1A1P5Q5VTE0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EEF1A1P5Q5VTE0 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EEF1A1P5Q5VTE0 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EEF1A1P5Q5VTE0 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EEF1A1P5Q5VTE0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EEF1A1P5Q5VTE0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EEF1A1P5Q5VTE0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EEF1A1P5Q5VTE0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EEF1A1P5Q5VTE0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EEF1A1P5Q5VTE0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EEF1A1P5Q5VTE0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
EEF1A1P5Q5VTE0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EEF1A1P5Q5VTE0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EEF1A1P5Q5VTE0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EEF1A1P5Q5VTE0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EEF1A1P5Q5VTE0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EEF1A1P5Q5VTE0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EEF1A1P5Q5VTE0 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EEF1A1P5Q5VTE0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EEF1A1P5Q5VTE0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EEF1A1P5Q5VTE0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EEF1A1P5Q5VTE0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EEF1A1P5Q5VTE0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EEF1A1P5Q5VTE0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EEF1A1P5Q5VTE0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EEF1A1P5Q5VTE0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
EEF1A1P5Q5VTE0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EEF1A1P5Q5VTE0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EEF1A1P5Q5VTE0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EEF1A1P5Q5VTE0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EEF1A1P5Q5VTE0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EEF1A1P5Q5VTE0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EEF1A1P5Q5VTE0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EEF1A1P5Q5VTE0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EEF1A1P5Q5VTE0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EEF1A1P5Q5VTE0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EEF1A1P5Q5VTE0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EEF1A1P5Q5VTE0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EEF1A1P5Q5VTE0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EEF1A1P5Q5VTE0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EEF1A1P5Q5VTE0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EEF1A1P5Q5VTE0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EEF1A1P5Q5VTE0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EEF1A1P5Q5VTE0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EEF1A1P5Q5VTE0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EEF1A1P5Q5VTE0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EEF1A1P5Q5VTE0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EEF1A1P5Q5VTE0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EEF1A1P5Q5VTE0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EEF1A1P5Q5VTE0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EEF1A1P5Q5VTE0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms