Protein–RNA interactions for Protein: Q5T9A4

ATAD3B, ATPase family AAA domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3BQ5T9A4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATAD3BQ5T9A4 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATAD3BQ5T9A4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATAD3BQ5T9A4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATAD3BQ5T9A4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATAD3BQ5T9A4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATAD3BQ5T9A4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATAD3BQ5T9A4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATAD3BQ5T9A4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATAD3BQ5T9A4 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATAD3BQ5T9A4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATAD3BQ5T9A4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATAD3BQ5T9A4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATAD3BQ5T9A4 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATAD3BQ5T9A4 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATAD3BQ5T9A4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATAD3BQ5T9A4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATAD3BQ5T9A4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATAD3BQ5T9A4 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATAD3BQ5T9A4 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ATAD3BQ5T9A4 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATAD3BQ5T9A4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATAD3BQ5T9A4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATAD3BQ5T9A4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATAD3BQ5T9A4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATAD3BQ5T9A4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATAD3BQ5T9A4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATAD3BQ5T9A4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATAD3BQ5T9A4 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATAD3BQ5T9A4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATAD3BQ5T9A4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
ATAD3BQ5T9A4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATAD3BQ5T9A4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATAD3BQ5T9A4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATAD3BQ5T9A4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATAD3BQ5T9A4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATAD3BQ5T9A4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATAD3BQ5T9A4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATAD3BQ5T9A4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATAD3BQ5T9A4 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ATAD3BQ5T9A4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATAD3BQ5T9A4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATAD3BQ5T9A4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATAD3BQ5T9A4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATAD3BQ5T9A4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATAD3BQ5T9A4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATAD3BQ5T9A4 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATAD3BQ5T9A4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATAD3BQ5T9A4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATAD3BQ5T9A4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATAD3BQ5T9A4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ATAD3BQ5T9A4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATAD3BQ5T9A4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATAD3BQ5T9A4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATAD3BQ5T9A4 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATAD3BQ5T9A4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ATAD3BQ5T9A4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATAD3BQ5T9A4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATAD3BQ5T9A4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATAD3BQ5T9A4 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATAD3BQ5T9A4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATAD3BQ5T9A4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATAD3BQ5T9A4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATAD3BQ5T9A4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATAD3BQ5T9A4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATAD3BQ5T9A4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATAD3BQ5T9A4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ATAD3BQ5T9A4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATAD3BQ5T9A4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATAD3BQ5T9A4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ATAD3BQ5T9A4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATAD3BQ5T9A4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ATAD3BQ5T9A4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATAD3BQ5T9A4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATAD3BQ5T9A4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATAD3BQ5T9A4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATAD3BQ5T9A4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATAD3BQ5T9A4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATAD3BQ5T9A4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATAD3BQ5T9A4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATAD3BQ5T9A4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATAD3BQ5T9A4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATAD3BQ5T9A4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATAD3BQ5T9A4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATAD3BQ5T9A4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATAD3BQ5T9A4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATAD3BQ5T9A4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATAD3BQ5T9A4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATAD3BQ5T9A4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATAD3BQ5T9A4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATAD3BQ5T9A4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATAD3BQ5T9A4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATAD3BQ5T9A4 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATAD3BQ5T9A4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATAD3BQ5T9A4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATAD3BQ5T9A4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATAD3BQ5T9A4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATAD3BQ5T9A4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATAD3BQ5T9A4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATAD3BQ5T9A4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms