Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2R2

PDSS1, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS1Q5T2R2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDSS1Q5T2R2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDSS1Q5T2R2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDSS1Q5T2R2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDSS1Q5T2R2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDSS1Q5T2R2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDSS1Q5T2R2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDSS1Q5T2R2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDSS1Q5T2R2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDSS1Q5T2R2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDSS1Q5T2R2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDSS1Q5T2R2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDSS1Q5T2R2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDSS1Q5T2R2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDSS1Q5T2R2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDSS1Q5T2R2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDSS1Q5T2R2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDSS1Q5T2R2 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDSS1Q5T2R2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PDSS1Q5T2R2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDSS1Q5T2R2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDSS1Q5T2R2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDSS1Q5T2R2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDSS1Q5T2R2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDSS1Q5T2R2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDSS1Q5T2R2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDSS1Q5T2R2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDSS1Q5T2R2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDSS1Q5T2R2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDSS1Q5T2R2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDSS1Q5T2R2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDSS1Q5T2R2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDSS1Q5T2R2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDSS1Q5T2R2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDSS1Q5T2R2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDSS1Q5T2R2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDSS1Q5T2R2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDSS1Q5T2R2 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDSS1Q5T2R2 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDSS1Q5T2R2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDSS1Q5T2R2 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDSS1Q5T2R2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDSS1Q5T2R2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDSS1Q5T2R2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDSS1Q5T2R2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDSS1Q5T2R2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDSS1Q5T2R2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDSS1Q5T2R2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDSS1Q5T2R2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PDSS1Q5T2R2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDSS1Q5T2R2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDSS1Q5T2R2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDSS1Q5T2R2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PDSS1Q5T2R2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDSS1Q5T2R2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDSS1Q5T2R2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDSS1Q5T2R2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDSS1Q5T2R2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDSS1Q5T2R2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDSS1Q5T2R2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDSS1Q5T2R2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDSS1Q5T2R2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDSS1Q5T2R2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDSS1Q5T2R2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDSS1Q5T2R2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDSS1Q5T2R2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDSS1Q5T2R2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDSS1Q5T2R2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDSS1Q5T2R2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDSS1Q5T2R2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDSS1Q5T2R2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDSS1Q5T2R2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDSS1Q5T2R2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDSS1Q5T2R2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDSS1Q5T2R2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDSS1Q5T2R2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDSS1Q5T2R2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDSS1Q5T2R2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PDSS1Q5T2R2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDSS1Q5T2R2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDSS1Q5T2R2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDSS1Q5T2R2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PDSS1Q5T2R2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDSS1Q5T2R2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDSS1Q5T2R2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDSS1Q5T2R2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDSS1Q5T2R2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDSS1Q5T2R2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDSS1Q5T2R2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDSS1Q5T2R2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDSS1Q5T2R2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDSS1Q5T2R2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDSS1Q5T2R2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDSS1Q5T2R2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDSS1Q5T2R2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDSS1Q5T2R2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDSS1Q5T2R2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDSS1Q5T2R2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDSS1Q5T2R2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDSS1Q5T2R2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms