Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2N8

ATAD3C, ATPase family AAA domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3CQ5T2N8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATAD3CQ5T2N8 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ATAD3CQ5T2N8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATAD3CQ5T2N8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATAD3CQ5T2N8 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATAD3CQ5T2N8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATAD3CQ5T2N8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATAD3CQ5T2N8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ATAD3CQ5T2N8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATAD3CQ5T2N8 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATAD3CQ5T2N8 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATAD3CQ5T2N8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATAD3CQ5T2N8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATAD3CQ5T2N8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ATAD3CQ5T2N8 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATAD3CQ5T2N8 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATAD3CQ5T2N8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATAD3CQ5T2N8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATAD3CQ5T2N8 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATAD3CQ5T2N8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATAD3CQ5T2N8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATAD3CQ5T2N8 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATAD3CQ5T2N8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATAD3CQ5T2N8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATAD3CQ5T2N8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATAD3CQ5T2N8 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATAD3CQ5T2N8 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATAD3CQ5T2N8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATAD3CQ5T2N8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATAD3CQ5T2N8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATAD3CQ5T2N8 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATAD3CQ5T2N8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATAD3CQ5T2N8 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATAD3CQ5T2N8 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATAD3CQ5T2N8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATAD3CQ5T2N8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATAD3CQ5T2N8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATAD3CQ5T2N8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATAD3CQ5T2N8 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATAD3CQ5T2N8 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATAD3CQ5T2N8 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATAD3CQ5T2N8 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATAD3CQ5T2N8 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATAD3CQ5T2N8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATAD3CQ5T2N8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATAD3CQ5T2N8 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATAD3CQ5T2N8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATAD3CQ5T2N8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATAD3CQ5T2N8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATAD3CQ5T2N8 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATAD3CQ5T2N8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATAD3CQ5T2N8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATAD3CQ5T2N8 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATAD3CQ5T2N8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATAD3CQ5T2N8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATAD3CQ5T2N8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATAD3CQ5T2N8 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATAD3CQ5T2N8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATAD3CQ5T2N8 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATAD3CQ5T2N8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATAD3CQ5T2N8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATAD3CQ5T2N8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ATAD3CQ5T2N8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATAD3CQ5T2N8 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATAD3CQ5T2N8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATAD3CQ5T2N8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATAD3CQ5T2N8 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATAD3CQ5T2N8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATAD3CQ5T2N8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATAD3CQ5T2N8 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATAD3CQ5T2N8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATAD3CQ5T2N8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATAD3CQ5T2N8 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATAD3CQ5T2N8 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATAD3CQ5T2N8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATAD3CQ5T2N8 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATAD3CQ5T2N8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATAD3CQ5T2N8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATAD3CQ5T2N8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATAD3CQ5T2N8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATAD3CQ5T2N8 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATAD3CQ5T2N8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATAD3CQ5T2N8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATAD3CQ5T2N8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATAD3CQ5T2N8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ATAD3CQ5T2N8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATAD3CQ5T2N8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATAD3CQ5T2N8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATAD3CQ5T2N8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATAD3CQ5T2N8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATAD3CQ5T2N8 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATAD3CQ5T2N8 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATAD3CQ5T2N8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATAD3CQ5T2N8 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATAD3CQ5T2N8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATAD3CQ5T2N8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATAD3CQ5T2N8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATAD3CQ5T2N8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATAD3CQ5T2N8 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATAD3CQ5T2N8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.7 ms