Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUW0

KRBOX4, KRAB domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRBOX4Q5JUW0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRBOX4Q5JUW0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRBOX4Q5JUW0 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRBOX4Q5JUW0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRBOX4Q5JUW0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRBOX4Q5JUW0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRBOX4Q5JUW0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRBOX4Q5JUW0 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRBOX4Q5JUW0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
KRBOX4Q5JUW0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRBOX4Q5JUW0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRBOX4Q5JUW0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRBOX4Q5JUW0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRBOX4Q5JUW0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
KRBOX4Q5JUW0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRBOX4Q5JUW0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRBOX4Q5JUW0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRBOX4Q5JUW0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRBOX4Q5JUW0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRBOX4Q5JUW0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRBOX4Q5JUW0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRBOX4Q5JUW0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRBOX4Q5JUW0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRBOX4Q5JUW0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRBOX4Q5JUW0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
KRBOX4Q5JUW0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRBOX4Q5JUW0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRBOX4Q5JUW0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
KRBOX4Q5JUW0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRBOX4Q5JUW0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRBOX4Q5JUW0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRBOX4Q5JUW0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRBOX4Q5JUW0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRBOX4Q5JUW0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRBOX4Q5JUW0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRBOX4Q5JUW0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRBOX4Q5JUW0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRBOX4Q5JUW0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRBOX4Q5JUW0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRBOX4Q5JUW0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRBOX4Q5JUW0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRBOX4Q5JUW0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRBOX4Q5JUW0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRBOX4Q5JUW0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRBOX4Q5JUW0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
KRBOX4Q5JUW0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRBOX4Q5JUW0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRBOX4Q5JUW0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRBOX4Q5JUW0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRBOX4Q5JUW0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRBOX4Q5JUW0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRBOX4Q5JUW0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRBOX4Q5JUW0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRBOX4Q5JUW0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRBOX4Q5JUW0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRBOX4Q5JUW0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRBOX4Q5JUW0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRBOX4Q5JUW0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRBOX4Q5JUW0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRBOX4Q5JUW0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRBOX4Q5JUW0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRBOX4Q5JUW0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRBOX4Q5JUW0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRBOX4Q5JUW0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRBOX4Q5JUW0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
KRBOX4Q5JUW0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRBOX4Q5JUW0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRBOX4Q5JUW0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRBOX4Q5JUW0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRBOX4Q5JUW0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRBOX4Q5JUW0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KRBOX4Q5JUW0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRBOX4Q5JUW0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRBOX4Q5JUW0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRBOX4Q5JUW0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRBOX4Q5JUW0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRBOX4Q5JUW0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRBOX4Q5JUW0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRBOX4Q5JUW0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRBOX4Q5JUW0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRBOX4Q5JUW0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRBOX4Q5JUW0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRBOX4Q5JUW0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRBOX4Q5JUW0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRBOX4Q5JUW0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRBOX4Q5JUW0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRBOX4Q5JUW0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRBOX4Q5JUW0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRBOX4Q5JUW0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRBOX4Q5JUW0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRBOX4Q5JUW0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRBOX4Q5JUW0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRBOX4Q5JUW0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRBOX4Q5JUW0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRBOX4Q5JUW0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRBOX4Q5JUW0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRBOX4Q5JUW0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRBOX4Q5JUW0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KRBOX4Q5JUW0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRBOX4Q5JUW0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.8 ms