Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUW0

KRBOX4, KRAB domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRBOX4Q5JUW0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRBOX4Q5JUW0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRBOX4Q5JUW0 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRBOX4Q5JUW0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRBOX4Q5JUW0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRBOX4Q5JUW0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRBOX4Q5JUW0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRBOX4Q5JUW0 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRBOX4Q5JUW0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
KRBOX4Q5JUW0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRBOX4Q5JUW0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRBOX4Q5JUW0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRBOX4Q5JUW0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRBOX4Q5JUW0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
KRBOX4Q5JUW0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRBOX4Q5JUW0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRBOX4Q5JUW0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRBOX4Q5JUW0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRBOX4Q5JUW0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRBOX4Q5JUW0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRBOX4Q5JUW0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRBOX4Q5JUW0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRBOX4Q5JUW0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRBOX4Q5JUW0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRBOX4Q5JUW0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
KRBOX4Q5JUW0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRBOX4Q5JUW0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRBOX4Q5JUW0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
KRBOX4Q5JUW0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRBOX4Q5JUW0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRBOX4Q5JUW0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRBOX4Q5JUW0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRBOX4Q5JUW0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRBOX4Q5JUW0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRBOX4Q5JUW0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRBOX4Q5JUW0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRBOX4Q5JUW0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRBOX4Q5JUW0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRBOX4Q5JUW0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRBOX4Q5JUW0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRBOX4Q5JUW0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRBOX4Q5JUW0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRBOX4Q5JUW0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRBOX4Q5JUW0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRBOX4Q5JUW0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
KRBOX4Q5JUW0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRBOX4Q5JUW0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRBOX4Q5JUW0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRBOX4Q5JUW0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRBOX4Q5JUW0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRBOX4Q5JUW0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRBOX4Q5JUW0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRBOX4Q5JUW0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRBOX4Q5JUW0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRBOX4Q5JUW0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRBOX4Q5JUW0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRBOX4Q5JUW0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRBOX4Q5JUW0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRBOX4Q5JUW0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRBOX4Q5JUW0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRBOX4Q5JUW0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRBOX4Q5JUW0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRBOX4Q5JUW0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRBOX4Q5JUW0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRBOX4Q5JUW0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
KRBOX4Q5JUW0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRBOX4Q5JUW0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRBOX4Q5JUW0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRBOX4Q5JUW0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRBOX4Q5JUW0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRBOX4Q5JUW0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KRBOX4Q5JUW0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRBOX4Q5JUW0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRBOX4Q5JUW0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRBOX4Q5JUW0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRBOX4Q5JUW0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRBOX4Q5JUW0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRBOX4Q5JUW0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRBOX4Q5JUW0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRBOX4Q5JUW0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRBOX4Q5JUW0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRBOX4Q5JUW0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRBOX4Q5JUW0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRBOX4Q5JUW0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRBOX4Q5JUW0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRBOX4Q5JUW0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRBOX4Q5JUW0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRBOX4Q5JUW0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRBOX4Q5JUW0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRBOX4Q5JUW0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRBOX4Q5JUW0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRBOX4Q5JUW0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRBOX4Q5JUW0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRBOX4Q5JUW0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRBOX4Q5JUW0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRBOX4Q5JUW0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRBOX4Q5JUW0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRBOX4Q5JUW0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KRBOX4Q5JUW0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRBOX4Q5JUW0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms