Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTW2

CEP78, Centrosomal protein of 78 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP78Q5JTW2 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CEP78Q5JTW2 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CEP78Q5JTW2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CEP78Q5JTW2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CEP78Q5JTW2 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CEP78Q5JTW2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CEP78Q5JTW2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CEP78Q5JTW2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CEP78Q5JTW2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CEP78Q5JTW2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CEP78Q5JTW2 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CEP78Q5JTW2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CEP78Q5JTW2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CEP78Q5JTW2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CEP78Q5JTW2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CEP78Q5JTW2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CEP78Q5JTW2 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CEP78Q5JTW2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CEP78Q5JTW2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CEP78Q5JTW2 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CEP78Q5JTW2 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CEP78Q5JTW2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CEP78Q5JTW2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CEP78Q5JTW2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CEP78Q5JTW2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CEP78Q5JTW2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CEP78Q5JTW2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CEP78Q5JTW2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CEP78Q5JTW2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CEP78Q5JTW2 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CEP78Q5JTW2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CEP78Q5JTW2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CEP78Q5JTW2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CEP78Q5JTW2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CEP78Q5JTW2 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CEP78Q5JTW2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CEP78Q5JTW2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CEP78Q5JTW2 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CEP78Q5JTW2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CEP78Q5JTW2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CEP78Q5JTW2 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEP78Q5JTW2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEP78Q5JTW2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEP78Q5JTW2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEP78Q5JTW2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CEP78Q5JTW2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CEP78Q5JTW2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CEP78Q5JTW2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CEP78Q5JTW2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CEP78Q5JTW2 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CEP78Q5JTW2 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CEP78Q5JTW2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CEP78Q5JTW2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CEP78Q5JTW2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CEP78Q5JTW2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CEP78Q5JTW2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CEP78Q5JTW2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CEP78Q5JTW2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CEP78Q5JTW2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CEP78Q5JTW2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CEP78Q5JTW2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CEP78Q5JTW2 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CEP78Q5JTW2 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CEP78Q5JTW2 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CEP78Q5JTW2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CEP78Q5JTW2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CEP78Q5JTW2 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CEP78Q5JTW2 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CEP78Q5JTW2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CEP78Q5JTW2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CEP78Q5JTW2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CEP78Q5JTW2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CEP78Q5JTW2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CEP78Q5JTW2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CEP78Q5JTW2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CEP78Q5JTW2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CEP78Q5JTW2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CEP78Q5JTW2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CEP78Q5JTW2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CEP78Q5JTW2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CEP78Q5JTW2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CEP78Q5JTW2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CEP78Q5JTW2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CEP78Q5JTW2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CEP78Q5JTW2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CEP78Q5JTW2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CEP78Q5JTW2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CEP78Q5JTW2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CEP78Q5JTW2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CEP78Q5JTW2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEP78Q5JTW2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEP78Q5JTW2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CEP78Q5JTW2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CEP78Q5JTW2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CEP78Q5JTW2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CEP78Q5JTW2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CEP78Q5JTW2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CEP78Q5JTW2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CEP78Q5JTW2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CEP78Q5JTW2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms