Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRA6

MIA3, Transport and Golgi organization protein 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIA3Q5JRA6 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
MIA3Q5JRA6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
MIA3Q5JRA6 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
MIA3Q5JRA6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MIA3Q5JRA6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MIA3Q5JRA6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
MIA3Q5JRA6 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
MIA3Q5JRA6 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
MIA3Q5JRA6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
MIA3Q5JRA6 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
MIA3Q5JRA6 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
MIA3Q5JRA6 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
MIA3Q5JRA6 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
MIA3Q5JRA6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
MIA3Q5JRA6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
MIA3Q5JRA6 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
MIA3Q5JRA6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MIA3Q5JRA6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
MIA3Q5JRA6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MIA3Q5JRA6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MIA3Q5JRA6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
MIA3Q5JRA6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MIA3Q5JRA6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MIA3Q5JRA6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
MIA3Q5JRA6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MIA3Q5JRA6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
MIA3Q5JRA6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
MIA3Q5JRA6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
MIA3Q5JRA6 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MIA3Q5JRA6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MIA3Q5JRA6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MIA3Q5JRA6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
MIA3Q5JRA6 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MIA3Q5JRA6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MIA3Q5JRA6 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MIA3Q5JRA6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
MIA3Q5JRA6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MIA3Q5JRA6 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MIA3Q5JRA6 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MIA3Q5JRA6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
MIA3Q5JRA6 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MIA3Q5JRA6 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MIA3Q5JRA6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
MIA3Q5JRA6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MIA3Q5JRA6 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MIA3Q5JRA6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MIA3Q5JRA6 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MIA3Q5JRA6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MIA3Q5JRA6 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MIA3Q5JRA6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MIA3Q5JRA6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MIA3Q5JRA6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
MIA3Q5JRA6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MIA3Q5JRA6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
MIA3Q5JRA6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
MIA3Q5JRA6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
MIA3Q5JRA6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
MIA3Q5JRA6 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MIA3Q5JRA6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
MIA3Q5JRA6 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
MIA3Q5JRA6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MIA3Q5JRA6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
MIA3Q5JRA6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
MIA3Q5JRA6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
MIA3Q5JRA6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MIA3Q5JRA6 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MIA3Q5JRA6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MIA3Q5JRA6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MIA3Q5JRA6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
MIA3Q5JRA6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MIA3Q5JRA6 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MIA3Q5JRA6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MIA3Q5JRA6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
MIA3Q5JRA6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MIA3Q5JRA6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MIA3Q5JRA6 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MIA3Q5JRA6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
MIA3Q5JRA6 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
MIA3Q5JRA6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
MIA3Q5JRA6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MIA3Q5JRA6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MIA3Q5JRA6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
MIA3Q5JRA6 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MIA3Q5JRA6 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MIA3Q5JRA6 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MIA3Q5JRA6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MIA3Q5JRA6 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MIA3Q5JRA6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
MIA3Q5JRA6 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MIA3Q5JRA6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MIA3Q5JRA6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MIA3Q5JRA6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
MIA3Q5JRA6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MIA3Q5JRA6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
MIA3Q5JRA6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MIA3Q5JRA6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MIA3Q5JRA6 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MIA3Q5JRA6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MIA3Q5JRA6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MIA3Q5JRA6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms