Protein–RNA interactions for Protein: Q5HYW3

RTL5, Retrotransposon Gag-like protein 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL5Q5HYW3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
RTL5Q5HYW3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC35.72■■■■□ 3.31
RTL5Q5HYW3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
RTL5Q5HYW3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC35.71■■■■□ 3.31
RTL5Q5HYW3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
RTL5Q5HYW3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
RTL5Q5HYW3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
RTL5Q5HYW3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
RTL5Q5HYW3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
RTL5Q5HYW3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
RTL5Q5HYW3 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
RTL5Q5HYW3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
RTL5Q5HYW3 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
RTL5Q5HYW3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
RTL5Q5HYW3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
RTL5Q5HYW3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
RTL5Q5HYW3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
RTL5Q5HYW3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
RTL5Q5HYW3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
RTL5Q5HYW3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC35.62■■■■□ 3.29
RTL5Q5HYW3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
RTL5Q5HYW3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
RTL5Q5HYW3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
RTL5Q5HYW3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
RTL5Q5HYW3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC35.57■■■■□ 3.28
RTL5Q5HYW3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
RTL5Q5HYW3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
RTL5Q5HYW3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
RTL5Q5HYW3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
RTL5Q5HYW3 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC35.5■■■■□ 3.27
RTL5Q5HYW3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
RTL5Q5HYW3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
RTL5Q5HYW3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
RTL5Q5HYW3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
RTL5Q5HYW3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
RTL5Q5HYW3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
RTL5Q5HYW3 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
RTL5Q5HYW3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
RTL5Q5HYW3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
RTL5Q5HYW3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
RTL5Q5HYW3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC35.42■■■■□ 3.26
RTL5Q5HYW3 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
RTL5Q5HYW3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
RTL5Q5HYW3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
RTL5Q5HYW3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
RTL5Q5HYW3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
RTL5Q5HYW3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
RTL5Q5HYW3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
RTL5Q5HYW3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
RTL5Q5HYW3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
RTL5Q5HYW3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
RTL5Q5HYW3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
RTL5Q5HYW3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
RTL5Q5HYW3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
RTL5Q5HYW3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
RTL5Q5HYW3 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
RTL5Q5HYW3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
RTL5Q5HYW3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
RTL5Q5HYW3 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
RTL5Q5HYW3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
RTL5Q5HYW3 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
RTL5Q5HYW3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
RTL5Q5HYW3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
RTL5Q5HYW3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
RTL5Q5HYW3 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
RTL5Q5HYW3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
RTL5Q5HYW3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
RTL5Q5HYW3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.16■■■■□ 3.22
RTL5Q5HYW3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
RTL5Q5HYW3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC35.16■■■■□ 3.22
RTL5Q5HYW3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
RTL5Q5HYW3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
RTL5Q5HYW3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
RTL5Q5HYW3 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
RTL5Q5HYW3 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
RTL5Q5HYW3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
RTL5Q5HYW3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
RTL5Q5HYW3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
RTL5Q5HYW3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
RTL5Q5HYW3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.11■■■■□ 3.21
RTL5Q5HYW3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC35.1■■■■□ 3.21
RTL5Q5HYW3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
RTL5Q5HYW3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
RTL5Q5HYW3 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
RTL5Q5HYW3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
RTL5Q5HYW3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
RTL5Q5HYW3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
RTL5Q5HYW3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
RTL5Q5HYW3 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
RTL5Q5HYW3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
RTL5Q5HYW3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
RTL5Q5HYW3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
RTL5Q5HYW3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
RTL5Q5HYW3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
RTL5Q5HYW3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
RTL5Q5HYW3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC34.93■■■■□ 3.18
RTL5Q5HYW3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
RTL5Q5HYW3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
RTL5Q5HYW3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
RTL5Q5HYW3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms