Protein–RNA interactions for Protein: Q53HV7

SMUG1, Single-strand selective monofunctional uracil DNA glycosylase, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMUG1Q53HV7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMUG1Q53HV7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMUG1Q53HV7 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMUG1Q53HV7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMUG1Q53HV7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMUG1Q53HV7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMUG1Q53HV7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMUG1Q53HV7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMUG1Q53HV7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMUG1Q53HV7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMUG1Q53HV7 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMUG1Q53HV7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMUG1Q53HV7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SMUG1Q53HV7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMUG1Q53HV7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMUG1Q53HV7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMUG1Q53HV7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMUG1Q53HV7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMUG1Q53HV7 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMUG1Q53HV7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMUG1Q53HV7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMUG1Q53HV7 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMUG1Q53HV7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMUG1Q53HV7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMUG1Q53HV7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMUG1Q53HV7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMUG1Q53HV7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMUG1Q53HV7 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMUG1Q53HV7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMUG1Q53HV7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMUG1Q53HV7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SMUG1Q53HV7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMUG1Q53HV7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMUG1Q53HV7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMUG1Q53HV7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMUG1Q53HV7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMUG1Q53HV7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMUG1Q53HV7 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMUG1Q53HV7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMUG1Q53HV7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMUG1Q53HV7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMUG1Q53HV7 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMUG1Q53HV7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMUG1Q53HV7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMUG1Q53HV7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMUG1Q53HV7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMUG1Q53HV7 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMUG1Q53HV7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMUG1Q53HV7 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMUG1Q53HV7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMUG1Q53HV7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMUG1Q53HV7 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMUG1Q53HV7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMUG1Q53HV7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMUG1Q53HV7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SMUG1Q53HV7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SMUG1Q53HV7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SMUG1Q53HV7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMUG1Q53HV7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMUG1Q53HV7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMUG1Q53HV7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMUG1Q53HV7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMUG1Q53HV7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMUG1Q53HV7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SMUG1Q53HV7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMUG1Q53HV7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMUG1Q53HV7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMUG1Q53HV7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMUG1Q53HV7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SMUG1Q53HV7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMUG1Q53HV7 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMUG1Q53HV7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMUG1Q53HV7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMUG1Q53HV7 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMUG1Q53HV7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMUG1Q53HV7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMUG1Q53HV7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMUG1Q53HV7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMUG1Q53HV7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMUG1Q53HV7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMUG1Q53HV7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMUG1Q53HV7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMUG1Q53HV7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMUG1Q53HV7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SMUG1Q53HV7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMUG1Q53HV7 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMUG1Q53HV7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMUG1Q53HV7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMUG1Q53HV7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMUG1Q53HV7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMUG1Q53HV7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMUG1Q53HV7 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMUG1Q53HV7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMUG1Q53HV7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMUG1Q53HV7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMUG1Q53HV7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMUG1Q53HV7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMUG1Q53HV7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMUG1Q53HV7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMUG1Q53HV7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms