Protein–RNA interactions for Protein: Q53H64

LINC00483, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00483, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00483Q53H64 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00483Q53H64 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00483Q53H64 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00483Q53H64 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00483Q53H64 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00483Q53H64 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00483Q53H64 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00483Q53H64 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00483Q53H64 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00483Q53H64 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00483Q53H64 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00483Q53H64 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00483Q53H64 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00483Q53H64 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00483Q53H64 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00483Q53H64 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00483Q53H64 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00483Q53H64 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00483Q53H64 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00483Q53H64 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00483Q53H64 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00483Q53H64 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00483Q53H64 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00483Q53H64 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00483Q53H64 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00483Q53H64 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00483Q53H64 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00483Q53H64 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00483Q53H64 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00483Q53H64 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00483Q53H64 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00483Q53H64 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00483Q53H64 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00483Q53H64 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00483Q53H64 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00483Q53H64 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LINC00483Q53H64 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00483Q53H64 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00483Q53H64 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00483Q53H64 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00483Q53H64 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00483Q53H64 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00483Q53H64 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00483Q53H64 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00483Q53H64 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00483Q53H64 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00483Q53H64 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00483Q53H64 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00483Q53H64 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00483Q53H64 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00483Q53H64 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00483Q53H64 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00483Q53H64 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00483Q53H64 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00483Q53H64 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00483Q53H64 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00483Q53H64 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00483Q53H64 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00483Q53H64 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00483Q53H64 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00483Q53H64 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00483Q53H64 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00483Q53H64 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00483Q53H64 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00483Q53H64 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00483Q53H64 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00483Q53H64 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00483Q53H64 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00483Q53H64 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00483Q53H64 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00483Q53H64 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00483Q53H64 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00483Q53H64 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00483Q53H64 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00483Q53H64 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00483Q53H64 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00483Q53H64 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00483Q53H64 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00483Q53H64 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00483Q53H64 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00483Q53H64 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00483Q53H64 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00483Q53H64 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00483Q53H64 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00483Q53H64 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00483Q53H64 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00483Q53H64 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00483Q53H64 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00483Q53H64 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00483Q53H64 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00483Q53H64 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00483Q53H64 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LINC00483Q53H64 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00483Q53H64 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00483Q53H64 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00483Q53H64 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00483Q53H64 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00483Q53H64 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00483Q53H64 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00483Q53H64 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms