Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF212Q495C1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF212Q495C1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF212Q495C1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF212Q495C1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF212Q495C1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF212Q495C1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF212Q495C1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF212Q495C1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF212Q495C1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF212Q495C1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF212Q495C1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF212Q495C1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF212Q495C1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF212Q495C1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF212Q495C1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF212Q495C1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RNF212Q495C1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RNF212Q495C1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RNF212Q495C1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RNF212Q495C1 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF212Q495C1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF212Q495C1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF212Q495C1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF212Q495C1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF212Q495C1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF212Q495C1 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF212Q495C1 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF212Q495C1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF212Q495C1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF212Q495C1 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF212Q495C1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF212Q495C1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RNF212Q495C1 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF212Q495C1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF212Q495C1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF212Q495C1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF212Q495C1 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF212Q495C1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF212Q495C1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF212Q495C1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF212Q495C1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF212Q495C1 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF212Q495C1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF212Q495C1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF212Q495C1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF212Q495C1 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF212Q495C1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF212Q495C1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF212Q495C1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF212Q495C1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF212Q495C1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RNF212Q495C1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RNF212Q495C1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RNF212Q495C1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RNF212Q495C1 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RNF212Q495C1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RNF212Q495C1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RNF212Q495C1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RNF212Q495C1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF212Q495C1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF212Q495C1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RNF212Q495C1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RNF212Q495C1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RNF212Q495C1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RNF212Q495C1 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RNF212Q495C1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RNF212Q495C1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RNF212Q495C1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RNF212Q495C1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RNF212Q495C1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RNF212Q495C1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RNF212Q495C1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RNF212Q495C1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RNF212Q495C1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RNF212Q495C1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RNF212Q495C1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF212Q495C1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF212Q495C1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF212Q495C1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF212Q495C1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF212Q495C1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF212Q495C1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RNF212Q495C1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RNF212Q495C1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RNF212Q495C1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF212Q495C1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF212Q495C1 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF212Q495C1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF212Q495C1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF212Q495C1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF212Q495C1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF212Q495C1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF212Q495C1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF212Q495C1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF212Q495C1 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF212Q495C1 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF212Q495C1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF212Q495C1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF212Q495C1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms