Protein–RNA interactions for Protein: Q494X3

ZNF404, Zinc finger protein 404, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF404Q494X3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF404Q494X3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF404Q494X3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF404Q494X3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF404Q494X3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF404Q494X3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF404Q494X3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF404Q494X3 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF404Q494X3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF404Q494X3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF404Q494X3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ZNF404Q494X3 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ZNF404Q494X3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF404Q494X3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF404Q494X3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF404Q494X3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF404Q494X3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF404Q494X3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF404Q494X3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF404Q494X3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF404Q494X3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF404Q494X3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF404Q494X3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF404Q494X3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF404Q494X3 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF404Q494X3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF404Q494X3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF404Q494X3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZNF404Q494X3 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF404Q494X3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF404Q494X3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF404Q494X3 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF404Q494X3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF404Q494X3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF404Q494X3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF404Q494X3 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF404Q494X3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF404Q494X3 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ZNF404Q494X3 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF404Q494X3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF404Q494X3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF404Q494X3 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF404Q494X3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF404Q494X3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF404Q494X3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF404Q494X3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF404Q494X3 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF404Q494X3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF404Q494X3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF404Q494X3 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF404Q494X3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF404Q494X3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF404Q494X3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF404Q494X3 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF404Q494X3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF404Q494X3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF404Q494X3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF404Q494X3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF404Q494X3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF404Q494X3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF404Q494X3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF404Q494X3 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF404Q494X3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF404Q494X3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF404Q494X3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF404Q494X3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF404Q494X3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF404Q494X3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF404Q494X3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF404Q494X3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF404Q494X3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF404Q494X3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF404Q494X3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF404Q494X3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF404Q494X3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF404Q494X3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF404Q494X3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF404Q494X3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF404Q494X3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF404Q494X3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF404Q494X3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF404Q494X3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF404Q494X3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF404Q494X3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF404Q494X3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF404Q494X3 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF404Q494X3 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF404Q494X3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF404Q494X3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF404Q494X3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF404Q494X3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF404Q494X3 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF404Q494X3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF404Q494X3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF404Q494X3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF404Q494X3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF404Q494X3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF404Q494X3 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF404Q494X3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF404Q494X3 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms