Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXP7

KIAA1644, Uncharacterized protein KIAA1644, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1644Q3SXP7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KIAA1644Q3SXP7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KIAA1644Q3SXP7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KIAA1644Q3SXP7 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KIAA1644Q3SXP7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KIAA1644Q3SXP7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KIAA1644Q3SXP7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
KIAA1644Q3SXP7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KIAA1644Q3SXP7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KIAA1644Q3SXP7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KIAA1644Q3SXP7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KIAA1644Q3SXP7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KIAA1644Q3SXP7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KIAA1644Q3SXP7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KIAA1644Q3SXP7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KIAA1644Q3SXP7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KIAA1644Q3SXP7 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KIAA1644Q3SXP7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KIAA1644Q3SXP7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KIAA1644Q3SXP7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KIAA1644Q3SXP7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KIAA1644Q3SXP7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KIAA1644Q3SXP7 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KIAA1644Q3SXP7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KIAA1644Q3SXP7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KIAA1644Q3SXP7 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KIAA1644Q3SXP7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KIAA1644Q3SXP7 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KIAA1644Q3SXP7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KIAA1644Q3SXP7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KIAA1644Q3SXP7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KIAA1644Q3SXP7 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KIAA1644Q3SXP7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KIAA1644Q3SXP7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KIAA1644Q3SXP7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KIAA1644Q3SXP7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KIAA1644Q3SXP7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KIAA1644Q3SXP7 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KIAA1644Q3SXP7 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KIAA1644Q3SXP7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KIAA1644Q3SXP7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KIAA1644Q3SXP7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KIAA1644Q3SXP7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
KIAA1644Q3SXP7 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
KIAA1644Q3SXP7 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
KIAA1644Q3SXP7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
KIAA1644Q3SXP7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
KIAA1644Q3SXP7 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
KIAA1644Q3SXP7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KIAA1644Q3SXP7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KIAA1644Q3SXP7 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KIAA1644Q3SXP7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
KIAA1644Q3SXP7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KIAA1644Q3SXP7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KIAA1644Q3SXP7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KIAA1644Q3SXP7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KIAA1644Q3SXP7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KIAA1644Q3SXP7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KIAA1644Q3SXP7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KIAA1644Q3SXP7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KIAA1644Q3SXP7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KIAA1644Q3SXP7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KIAA1644Q3SXP7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KIAA1644Q3SXP7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KIAA1644Q3SXP7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KIAA1644Q3SXP7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KIAA1644Q3SXP7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KIAA1644Q3SXP7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KIAA1644Q3SXP7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KIAA1644Q3SXP7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KIAA1644Q3SXP7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KIAA1644Q3SXP7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KIAA1644Q3SXP7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KIAA1644Q3SXP7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KIAA1644Q3SXP7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
KIAA1644Q3SXP7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KIAA1644Q3SXP7 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KIAA1644Q3SXP7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KIAA1644Q3SXP7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KIAA1644Q3SXP7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KIAA1644Q3SXP7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KIAA1644Q3SXP7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KIAA1644Q3SXP7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KIAA1644Q3SXP7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KIAA1644Q3SXP7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KIAA1644Q3SXP7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KIAA1644Q3SXP7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KIAA1644Q3SXP7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KIAA1644Q3SXP7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KIAA1644Q3SXP7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KIAA1644Q3SXP7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KIAA1644Q3SXP7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KIAA1644Q3SXP7 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KIAA1644Q3SXP7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KIAA1644Q3SXP7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KIAA1644Q3SXP7 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KIAA1644Q3SXP7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KIAA1644Q3SXP7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KIAA1644Q3SXP7 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KIAA1644Q3SXP7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms