Protein–RNA interactions for Protein: Q2YD98

UVSSA, UV-stimulated scaffold protein A, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UVSSAQ2YD98 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
UVSSAQ2YD98 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
UVSSAQ2YD98 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
UVSSAQ2YD98 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
UVSSAQ2YD98 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
UVSSAQ2YD98 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
UVSSAQ2YD98 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC31.61■■■□□ 2.65
UVSSAQ2YD98 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
UVSSAQ2YD98 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
UVSSAQ2YD98 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
UVSSAQ2YD98 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
UVSSAQ2YD98 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
UVSSAQ2YD98 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
UVSSAQ2YD98 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
UVSSAQ2YD98 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
UVSSAQ2YD98 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
UVSSAQ2YD98 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
UVSSAQ2YD98 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
UVSSAQ2YD98 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
UVSSAQ2YD98 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
UVSSAQ2YD98 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
UVSSAQ2YD98 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
UVSSAQ2YD98 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
UVSSAQ2YD98 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
UVSSAQ2YD98 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
UVSSAQ2YD98 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
UVSSAQ2YD98 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
UVSSAQ2YD98 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
UVSSAQ2YD98 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
UVSSAQ2YD98 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
UVSSAQ2YD98 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
UVSSAQ2YD98 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
UVSSAQ2YD98 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
UVSSAQ2YD98 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
UVSSAQ2YD98 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
UVSSAQ2YD98 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
UVSSAQ2YD98 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
UVSSAQ2YD98 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31.4■■■□□ 2.62
UVSSAQ2YD98 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
UVSSAQ2YD98 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
UVSSAQ2YD98 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
UVSSAQ2YD98 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
UVSSAQ2YD98 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
UVSSAQ2YD98 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
UVSSAQ2YD98 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
UVSSAQ2YD98 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
UVSSAQ2YD98 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
UVSSAQ2YD98 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
UVSSAQ2YD98 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
UVSSAQ2YD98 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
UVSSAQ2YD98 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
UVSSAQ2YD98 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
UVSSAQ2YD98 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
UVSSAQ2YD98 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
UVSSAQ2YD98 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
UVSSAQ2YD98 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
UVSSAQ2YD98 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
UVSSAQ2YD98 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
UVSSAQ2YD98 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
UVSSAQ2YD98 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
UVSSAQ2YD98 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
UVSSAQ2YD98 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
UVSSAQ2YD98 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
UVSSAQ2YD98 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
UVSSAQ2YD98 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
UVSSAQ2YD98 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
UVSSAQ2YD98 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
UVSSAQ2YD98 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
UVSSAQ2YD98 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
UVSSAQ2YD98 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
UVSSAQ2YD98 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
UVSSAQ2YD98 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
UVSSAQ2YD98 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
UVSSAQ2YD98 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
UVSSAQ2YD98 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
UVSSAQ2YD98 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
UVSSAQ2YD98 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
UVSSAQ2YD98 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
UVSSAQ2YD98 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.57
UVSSAQ2YD98 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
UVSSAQ2YD98 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
UVSSAQ2YD98 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
UVSSAQ2YD98 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
UVSSAQ2YD98 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
UVSSAQ2YD98 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
UVSSAQ2YD98 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
UVSSAQ2YD98 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
UVSSAQ2YD98 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
UVSSAQ2YD98 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
UVSSAQ2YD98 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
UVSSAQ2YD98 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
UVSSAQ2YD98 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
UVSSAQ2YD98 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
UVSSAQ2YD98 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
UVSSAQ2YD98 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
UVSSAQ2YD98 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
UVSSAQ2YD98 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
UVSSAQ2YD98 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
UVSSAQ2YD98 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
UVSSAQ2YD98 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms