Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKX8

ERCC6L, DNA excision repair protein ERCC-6-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6LQ2NKX8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ERCC6LQ2NKX8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
ERCC6LQ2NKX8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ERCC6LQ2NKX8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ERCC6LQ2NKX8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ERCC6LQ2NKX8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ERCC6LQ2NKX8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ERCC6LQ2NKX8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ERCC6LQ2NKX8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ERCC6LQ2NKX8 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ERCC6LQ2NKX8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ERCC6LQ2NKX8 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ERCC6LQ2NKX8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ERCC6LQ2NKX8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
ERCC6LQ2NKX8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ERCC6LQ2NKX8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ERCC6LQ2NKX8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ERCC6LQ2NKX8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ERCC6LQ2NKX8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ERCC6LQ2NKX8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ERCC6LQ2NKX8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ERCC6LQ2NKX8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ERCC6LQ2NKX8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ERCC6LQ2NKX8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ERCC6LQ2NKX8 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ERCC6LQ2NKX8 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ERCC6LQ2NKX8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ERCC6LQ2NKX8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ERCC6LQ2NKX8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ERCC6LQ2NKX8 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ERCC6LQ2NKX8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ERCC6LQ2NKX8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ERCC6LQ2NKX8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ERCC6LQ2NKX8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ERCC6LQ2NKX8 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ERCC6LQ2NKX8 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ERCC6LQ2NKX8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ERCC6LQ2NKX8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
ERCC6LQ2NKX8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ERCC6LQ2NKX8 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ERCC6LQ2NKX8 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ERCC6LQ2NKX8 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ERCC6LQ2NKX8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ERCC6LQ2NKX8 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ERCC6LQ2NKX8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ERCC6LQ2NKX8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ERCC6LQ2NKX8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ERCC6LQ2NKX8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ERCC6LQ2NKX8 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ERCC6LQ2NKX8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ERCC6LQ2NKX8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ERCC6LQ2NKX8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ERCC6LQ2NKX8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ERCC6LQ2NKX8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ERCC6LQ2NKX8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ERCC6LQ2NKX8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ERCC6LQ2NKX8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ERCC6LQ2NKX8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ERCC6LQ2NKX8 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ERCC6LQ2NKX8 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ERCC6LQ2NKX8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ERCC6LQ2NKX8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ERCC6LQ2NKX8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ERCC6LQ2NKX8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ERCC6LQ2NKX8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ERCC6LQ2NKX8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ERCC6LQ2NKX8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.25
ERCC6LQ2NKX8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
ERCC6LQ2NKX8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ERCC6LQ2NKX8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ERCC6LQ2NKX8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ERCC6LQ2NKX8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ERCC6LQ2NKX8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ERCC6LQ2NKX8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ERCC6LQ2NKX8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
ERCC6LQ2NKX8 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ERCC6LQ2NKX8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ERCC6LQ2NKX8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ERCC6LQ2NKX8 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ERCC6LQ2NKX8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ERCC6LQ2NKX8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ERCC6LQ2NKX8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ERCC6LQ2NKX8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ERCC6LQ2NKX8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ERCC6LQ2NKX8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ERCC6LQ2NKX8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ERCC6LQ2NKX8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ERCC6LQ2NKX8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ERCC6LQ2NKX8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ERCC6LQ2NKX8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ERCC6LQ2NKX8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ERCC6LQ2NKX8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ERCC6LQ2NKX8 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ERCC6LQ2NKX8 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ERCC6LQ2NKX8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ERCC6LQ2NKX8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ERCC6LQ2NKX8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ERCC6LQ2NKX8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ERCC6LQ2NKX8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ERCC6LQ2NKX8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms