Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
COL24A1Q17RW2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
COL24A1Q17RW2 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
COL24A1Q17RW2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
COL24A1Q17RW2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
COL24A1Q17RW2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC36.26■■■■□ 3.4
COL24A1Q17RW2 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
COL24A1Q17RW2 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
COL24A1Q17RW2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
COL24A1Q17RW2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
COL24A1Q17RW2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
COL24A1Q17RW2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
COL24A1Q17RW2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
COL24A1Q17RW2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
COL24A1Q17RW2 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
COL24A1Q17RW2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
COL24A1Q17RW2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
COL24A1Q17RW2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
COL24A1Q17RW2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
COL24A1Q17RW2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
COL24A1Q17RW2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
COL24A1Q17RW2 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
COL24A1Q17RW2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
COL24A1Q17RW2 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
COL24A1Q17RW2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
COL24A1Q17RW2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
COL24A1Q17RW2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
COL24A1Q17RW2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
COL24A1Q17RW2 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
COL24A1Q17RW2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
COL24A1Q17RW2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
COL24A1Q17RW2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.99■■■■□ 3.35
COL24A1Q17RW2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
COL24A1Q17RW2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC35.99■■■■□ 3.35
COL24A1Q17RW2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
COL24A1Q17RW2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
COL24A1Q17RW2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
COL24A1Q17RW2 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
COL24A1Q17RW2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
COL24A1Q17RW2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
COL24A1Q17RW2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.34
COL24A1Q17RW2 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
COL24A1Q17RW2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
COL24A1Q17RW2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
COL24A1Q17RW2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
COL24A1Q17RW2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC35.77■■■■□ 3.32
COL24A1Q17RW2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
COL24A1Q17RW2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
COL24A1Q17RW2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
COL24A1Q17RW2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
COL24A1Q17RW2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
COL24A1Q17RW2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC35.73■■■■□ 3.31
COL24A1Q17RW2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
COL24A1Q17RW2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
COL24A1Q17RW2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
COL24A1Q17RW2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC35.71■■■■□ 3.31
COL24A1Q17RW2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC35.71■■■■□ 3.31
COL24A1Q17RW2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC35.7■■■■□ 3.31
COL24A1Q17RW2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
COL24A1Q17RW2 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
COL24A1Q17RW2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
COL24A1Q17RW2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
COL24A1Q17RW2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
COL24A1Q17RW2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
COL24A1Q17RW2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
COL24A1Q17RW2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
COL24A1Q17RW2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC35.63■■■■□ 3.29
COL24A1Q17RW2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
COL24A1Q17RW2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
COL24A1Q17RW2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC35.6■■■■□ 3.29
COL24A1Q17RW2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
COL24A1Q17RW2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
COL24A1Q17RW2 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
COL24A1Q17RW2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC35.57■■■■□ 3.29
COL24A1Q17RW2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
COL24A1Q17RW2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
COL24A1Q17RW2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
COL24A1Q17RW2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
COL24A1Q17RW2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.53■■■■□ 3.28
COL24A1Q17RW2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.27
COL24A1Q17RW2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
COL24A1Q17RW2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
COL24A1Q17RW2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
COL24A1Q17RW2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
COL24A1Q17RW2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
COL24A1Q17RW2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
COL24A1Q17RW2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
COL24A1Q17RW2 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
COL24A1Q17RW2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
COL24A1Q17RW2 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC35.43■■■■□ 3.26
COL24A1Q17RW2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC35.43■■■■□ 3.26
COL24A1Q17RW2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
COL24A1Q17RW2 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
COL24A1Q17RW2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.39■■■■□ 3.26
COL24A1Q17RW2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
COL24A1Q17RW2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
COL24A1Q17RW2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC35.35■■■■□ 3.25
COL24A1Q17RW2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
COL24A1Q17RW2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
COL24A1Q17RW2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC35.32■■■■□ 3.25
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