Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC32.8■■■□□ 2.84
ME3Q16798 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
ME3Q16798 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
ME3Q16798 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
ME3Q16798 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
ME3Q16798 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC32.79■■■□□ 2.84
ME3Q16798 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
ME3Q16798 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
ME3Q16798 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
ME3Q16798 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
ME3Q16798 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
ME3Q16798 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
ME3Q16798 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
ME3Q16798 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
ME3Q16798 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
ME3Q16798 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
ME3Q16798 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
ME3Q16798 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
ME3Q16798 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
ME3Q16798 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
ME3Q16798 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
ME3Q16798 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
ME3Q16798 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
ME3Q16798 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
ME3Q16798 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
ME3Q16798 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
ME3Q16798 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC32.6■■■□□ 2.81
ME3Q16798 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
ME3Q16798 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
ME3Q16798 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
ME3Q16798 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.81
ME3Q16798 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
ME3Q16798 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
ME3Q16798 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
ME3Q16798 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
ME3Q16798 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
ME3Q16798 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
ME3Q16798 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
ME3Q16798 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
ME3Q16798 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
ME3Q16798 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
ME3Q16798 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
ME3Q16798 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
ME3Q16798 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
ME3Q16798 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
ME3Q16798 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
ME3Q16798 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
ME3Q16798 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
ME3Q16798 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
ME3Q16798 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
ME3Q16798 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
ME3Q16798 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
ME3Q16798 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
ME3Q16798 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
ME3Q16798 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
ME3Q16798 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
ME3Q16798 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
ME3Q16798 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
ME3Q16798 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
ME3Q16798 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
ME3Q16798 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
ME3Q16798 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
ME3Q16798 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
ME3Q16798 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
ME3Q16798 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC32.34■■■□□ 2.77
ME3Q16798 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
ME3Q16798 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
ME3Q16798 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
ME3Q16798 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
ME3Q16798 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
ME3Q16798 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC32.28■■■□□ 2.76
ME3Q16798 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
ME3Q16798 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
ME3Q16798 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
ME3Q16798 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
ME3Q16798 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
ME3Q16798 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
ME3Q16798 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
ME3Q16798 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
ME3Q16798 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
ME3Q16798 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
ME3Q16798 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
ME3Q16798 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
ME3Q16798 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
ME3Q16798 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
ME3Q16798 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
ME3Q16798 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
ME3Q16798 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
ME3Q16798 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
ME3Q16798 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
ME3Q16798 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
ME3Q16798 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
ME3Q16798 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC32.11■■■□□ 2.73
ME3Q16798 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ME3Q16798 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
ME3Q16798 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
ME3Q16798 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
ME3Q16798 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
ME3Q16798 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
ME3Q16798 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms