Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC32.8■■■□□ 2.84
ME3Q16798 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
ME3Q16798 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
ME3Q16798 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
ME3Q16798 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
ME3Q16798 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC32.79■■■□□ 2.84
ME3Q16798 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
ME3Q16798 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
ME3Q16798 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
ME3Q16798 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
ME3Q16798 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
ME3Q16798 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
ME3Q16798 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
ME3Q16798 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
ME3Q16798 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
ME3Q16798 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
ME3Q16798 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
ME3Q16798 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
ME3Q16798 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
ME3Q16798 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
ME3Q16798 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
ME3Q16798 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
ME3Q16798 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
ME3Q16798 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
ME3Q16798 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
ME3Q16798 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
ME3Q16798 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC32.6■■■□□ 2.81
ME3Q16798 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
ME3Q16798 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
ME3Q16798 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
ME3Q16798 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.81
ME3Q16798 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
ME3Q16798 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
ME3Q16798 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
ME3Q16798 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
ME3Q16798 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
ME3Q16798 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
ME3Q16798 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
ME3Q16798 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
ME3Q16798 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
ME3Q16798 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
ME3Q16798 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
ME3Q16798 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
ME3Q16798 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
ME3Q16798 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
ME3Q16798 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
ME3Q16798 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
ME3Q16798 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
ME3Q16798 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
ME3Q16798 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
ME3Q16798 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
ME3Q16798 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
ME3Q16798 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
ME3Q16798 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
ME3Q16798 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
ME3Q16798 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
ME3Q16798 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
ME3Q16798 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
ME3Q16798 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
ME3Q16798 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
ME3Q16798 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
ME3Q16798 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
ME3Q16798 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
ME3Q16798 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
ME3Q16798 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC32.34■■■□□ 2.77
ME3Q16798 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
ME3Q16798 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
ME3Q16798 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
ME3Q16798 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
ME3Q16798 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
ME3Q16798 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC32.28■■■□□ 2.76
ME3Q16798 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
ME3Q16798 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
ME3Q16798 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
ME3Q16798 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
ME3Q16798 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
ME3Q16798 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
ME3Q16798 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
ME3Q16798 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
ME3Q16798 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
ME3Q16798 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
ME3Q16798 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
ME3Q16798 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
ME3Q16798 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
ME3Q16798 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
ME3Q16798 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
ME3Q16798 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
ME3Q16798 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
ME3Q16798 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
ME3Q16798 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
ME3Q16798 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
ME3Q16798 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
ME3Q16798 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC32.11■■■□□ 2.73
ME3Q16798 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ME3Q16798 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
ME3Q16798 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
ME3Q16798 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
ME3Q16798 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
ME3Q16798 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
ME3Q16798 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
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