Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTF1Q16619 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTF1Q16619 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTF1Q16619 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTF1Q16619 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTF1Q16619 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTF1Q16619 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTF1Q16619 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTF1Q16619 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTF1Q16619 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTF1Q16619 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTF1Q16619 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTF1Q16619 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTF1Q16619 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTF1Q16619 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CTF1Q16619 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTF1Q16619 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTF1Q16619 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTF1Q16619 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTF1Q16619 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTF1Q16619 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTF1Q16619 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTF1Q16619 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CTF1Q16619 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTF1Q16619 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTF1Q16619 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTF1Q16619 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTF1Q16619 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTF1Q16619 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTF1Q16619 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CTF1Q16619 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTF1Q16619 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTF1Q16619 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTF1Q16619 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTF1Q16619 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTF1Q16619 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTF1Q16619 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTF1Q16619 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTF1Q16619 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTF1Q16619 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTF1Q16619 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTF1Q16619 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CTF1Q16619 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CTF1Q16619 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTF1Q16619 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTF1Q16619 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTF1Q16619 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTF1Q16619 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTF1Q16619 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTF1Q16619 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTF1Q16619 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTF1Q16619 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTF1Q16619 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTF1Q16619 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTF1Q16619 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTF1Q16619 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTF1Q16619 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTF1Q16619 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTF1Q16619 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTF1Q16619 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTF1Q16619 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTF1Q16619 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTF1Q16619 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTF1Q16619 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTF1Q16619 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTF1Q16619 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTF1Q16619 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTF1Q16619 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTF1Q16619 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTF1Q16619 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTF1Q16619 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTF1Q16619 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTF1Q16619 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTF1Q16619 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTF1Q16619 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTF1Q16619 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTF1Q16619 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CTF1Q16619 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTF1Q16619 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTF1Q16619 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CTF1Q16619 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CTF1Q16619 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CTF1Q16619 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CTF1Q16619 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTF1Q16619 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTF1Q16619 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTF1Q16619 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTF1Q16619 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTF1Q16619 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTF1Q16619 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTF1Q16619 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTF1Q16619 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTF1Q16619 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTF1Q16619 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTF1Q16619 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTF1Q16619 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTF1Q16619 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTF1Q16619 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTF1Q16619 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTF1Q16619 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms