Protein–RNA interactions for Protein: Q15835

GRK1, Rhodopsin kinase, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRK1Q15835 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRK1Q15835 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRK1Q15835 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRK1Q15835 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRK1Q15835 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRK1Q15835 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRK1Q15835 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRK1Q15835 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRK1Q15835 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GRK1Q15835 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GRK1Q15835 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRK1Q15835 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRK1Q15835 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRK1Q15835 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRK1Q15835 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRK1Q15835 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRK1Q15835 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GRK1Q15835 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRK1Q15835 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRK1Q15835 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRK1Q15835 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRK1Q15835 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRK1Q15835 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRK1Q15835 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRK1Q15835 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRK1Q15835 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GRK1Q15835 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GRK1Q15835 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GRK1Q15835 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRK1Q15835 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRK1Q15835 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRK1Q15835 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRK1Q15835 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRK1Q15835 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRK1Q15835 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRK1Q15835 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRK1Q15835 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRK1Q15835 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRK1Q15835 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRK1Q15835 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRK1Q15835 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRK1Q15835 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GRK1Q15835 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GRK1Q15835 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRK1Q15835 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRK1Q15835 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRK1Q15835 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRK1Q15835 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRK1Q15835 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRK1Q15835 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRK1Q15835 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRK1Q15835 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRK1Q15835 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRK1Q15835 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRK1Q15835 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRK1Q15835 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GRK1Q15835 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GRK1Q15835 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GRK1Q15835 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRK1Q15835 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRK1Q15835 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRK1Q15835 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRK1Q15835 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRK1Q15835 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRK1Q15835 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRK1Q15835 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRK1Q15835 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRK1Q15835 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRK1Q15835 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRK1Q15835 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRK1Q15835 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRK1Q15835 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRK1Q15835 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRK1Q15835 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRK1Q15835 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRK1Q15835 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GRK1Q15835 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRK1Q15835 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRK1Q15835 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRK1Q15835 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRK1Q15835 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRK1Q15835 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GRK1Q15835 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRK1Q15835 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRK1Q15835 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRK1Q15835 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRK1Q15835 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRK1Q15835 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRK1Q15835 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRK1Q15835 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRK1Q15835 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRK1Q15835 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRK1Q15835 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GRK1Q15835 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRK1Q15835 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRK1Q15835 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRK1Q15835 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRK1Q15835 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRK1Q15835 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRK1Q15835 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms