Protein–RNA interactions for Protein: Q15543

TAF13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF13Q15543 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TAF13Q15543 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TAF13Q15543 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TAF13Q15543 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TAF13Q15543 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TAF13Q15543 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TAF13Q15543 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TAF13Q15543 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TAF13Q15543 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TAF13Q15543 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TAF13Q15543 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TAF13Q15543 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TAF13Q15543 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TAF13Q15543 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TAF13Q15543 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TAF13Q15543 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TAF13Q15543 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TAF13Q15543 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TAF13Q15543 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TAF13Q15543 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TAF13Q15543 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TAF13Q15543 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TAF13Q15543 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TAF13Q15543 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TAF13Q15543 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TAF13Q15543 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TAF13Q15543 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TAF13Q15543 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TAF13Q15543 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TAF13Q15543 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TAF13Q15543 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TAF13Q15543 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TAF13Q15543 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TAF13Q15543 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TAF13Q15543 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TAF13Q15543 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TAF13Q15543 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAF13Q15543 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAF13Q15543 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TAF13Q15543 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TAF13Q15543 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TAF13Q15543 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TAF13Q15543 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TAF13Q15543 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TAF13Q15543 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TAF13Q15543 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TAF13Q15543 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TAF13Q15543 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TAF13Q15543 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TAF13Q15543 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TAF13Q15543 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TAF13Q15543 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TAF13Q15543 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TAF13Q15543 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TAF13Q15543 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TAF13Q15543 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TAF13Q15543 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TAF13Q15543 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TAF13Q15543 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TAF13Q15543 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TAF13Q15543 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TAF13Q15543 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TAF13Q15543 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TAF13Q15543 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TAF13Q15543 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TAF13Q15543 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TAF13Q15543 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TAF13Q15543 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TAF13Q15543 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TAF13Q15543 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TAF13Q15543 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF13Q15543 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF13Q15543 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF13Q15543 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF13Q15543 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF13Q15543 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TAF13Q15543 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TAF13Q15543 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TAF13Q15543 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TAF13Q15543 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TAF13Q15543 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TAF13Q15543 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TAF13Q15543 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TAF13Q15543 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TAF13Q15543 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TAF13Q15543 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TAF13Q15543 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TAF13Q15543 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TAF13Q15543 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TAF13Q15543 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TAF13Q15543 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TAF13Q15543 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TAF13Q15543 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TAF13Q15543 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TAF13Q15543 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TAF13Q15543 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TAF13Q15543 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TAF13Q15543 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TAF13Q15543 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TAF13Q15543 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms