Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 SNHG14-226ENST00000640631 13074 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.991e-9■■■■■ 64.3
PCBP1Q15365 SNHG14-217ENST00000552781 552 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.151e-9■■■■■ 64.3
PCBP1Q15365 DOT1L-202ENST00000446286 376 ntTSL 318.14■□□□□ 0.495e-10■■■■■ 64.2
PCBP1Q15365 PABPC1L-216ENST00000490798 1384 ntTSL 321.33■■□□□ 15e-10■■■■■ 63.4
PCBP1Q15365 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.975e-10■■■■■ 63.4
PCBP1Q15365 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.575e-10■■■■■ 63.4
PCBP1Q15365 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.535e-10■■■■■ 63.4
PCBP1Q15365 PABPC1L-211ENST00000476056 1214 ntTSL 513.13□□□□□ -0.315e-10■■■■■ 63.4
PCBP1Q15365 CTDNEP1-205ENST00000570828 986 ntTSL 313.75□□□□□ -0.214e-12■■■■■ 62.4
PCBP1Q15365 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.052e-17■■■■■ 62.3
PCBP1Q15365 HAMP-203ENST00000598398 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.114e-9■■■■■ 62.3
PCBP1Q15365 HAMP-201ENST00000222304 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.284e-9■■■■■ 62.3
PCBP1Q15365 PDE3A-202ENST00000542675 685 ntTSL 313.1□□□□□ -0.312e-17■■■■■ 62.3
PCBP1Q15365 HAMP-202ENST00000593580 2624 nt12.92□□□□□ -0.344e-9■■■■■ 62.3
PCBP1Q15365 SNX17-203ENST00000440760 1955 ntTSL 1 (best)20.55■□□□□ 0.884e-22■■■■■ 62.2
PCBP1Q15365 SNX17-202ENST00000427123 2007 ntTSL 220.15■□□□□ 0.824e-22■■■■■ 62.2
PCBP1Q15365 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.814e-22■■■■■ 62.2
PCBP1Q15365 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.534e-22■■■■■ 62.2
PCBP1Q15365 SNX17-204ENST00000453453 1638 ntTSL 1 (best)17.14■□□□□ 0.334e-22■■■■■ 62.2
PCBP1Q15365 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.393e-7■■■■■ 62
PCBP1Q15365 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.093e-7■■■■■ 62
PCBP1Q15365 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.532e-12■■■■■ 61.7
PCBP1Q15365 MLLT1-203ENST00000587473 556 ntTSL 215.77■□□□□ 0.122e-12■■■■■ 61.7
PCBP1Q15365 C9orf16-204ENST00000492588 1570 ntTSL 519.15■□□□□ 0.662e-9■■■■■ 61.5
PCBP1Q15365 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.272e-9■■■■■ 61.5
PCBP1Q15365 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.152e-27■■■■■ 61
PCBP1Q15365 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.072e-27■■■■■ 61
PCBP1Q15365 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.032e-27■■■■■ 61
PCBP1Q15365 STRAP-202ENST00000419869 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.113e-43■■■■■ 60.9
PCBP1Q15365 STRAP-201ENST00000025399 1442 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.643e-43■■■■■ 60.9
PCBP1Q15365 STRAP-206ENST00000541731 1698 ntTSL 210.85□□□□□ -0.673e-43■■■■■ 60.9
PCBP1Q15365 ETS2-202ENST00000360938 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.637e-7■■■■■ 60.6
PCBP1Q15365 ANKRD11-210ENST00000566858 580 ntTSL 417.8■□□□□ 0.444e-10■■■■■ 60.4
PCBP1Q15365 ANKRD11-212ENST00000567699 412 ntTSL 516.64■□□□□ 0.254e-10■■■■■ 60.4
PCBP1Q15365 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.124e-10■■■■■ 60.4
PCBP1Q15365 ANKRD11-213ENST00000567736 2750 ntTSL 215.53■□□□□ 0.084e-10■■■■■ 60.4
PCBP1Q15365 ANKRD11-216ENST00000568924 587 ntTSL 415.4■□□□□ 0.064e-10■■■■■ 60.4
PCBP1Q15365 ANKRD11-209ENST00000564553 471 ntTSL 315.32■□□□□ 0.044e-10■■■■■ 60.4
PCBP1Q15365 ANKRD11-206ENST00000562275 2762 ntTSL 514.16□□□□□ -0.144e-10■■■■■ 60.4
PCBP1Q15365 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.566e-9■■■■■ 60.1
PCBP1Q15365 NAPA-215ENST00000597271 1467 ntTSL 220.76■□□□□ 0.911e-6■■■■■ 60
PCBP1Q15365 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC14.63□□□□□ -0.071e-6■■■■■ 60
PCBP1Q15365 NAPA-207ENST00000594217 554 ntTSL 510.63□□□□□ -0.711e-6■■■■■ 60
PCBP1Q15365 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.231e-6■■■■■ 59.6
PCBP1Q15365 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.981e-6■■■■■ 59.6
PCBP1Q15365 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.183e-10■■■■■ 59.5
PCBP1Q15365 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.173e-10■■■■■ 59.5
PCBP1Q15365 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.13e-10■■■■■ 59.5
PCBP1Q15365 AGPAT1-203ENST00000375107 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.063e-10■■■■■ 59.5
PCBP1Q15365 AGPAT1-204ENST00000395496 2103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.263e-10■■■■■ 59.5
PCBP1Q15365 AGPAT1-206ENST00000395499 2496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.373e-10■■■■■ 59.5
PCBP1Q15365 AGPAT1-208ENST00000490711 2448 ntTSL 29.86□□□□□ -0.833e-10■■■■■ 59.5
PCBP1Q15365 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.082e-11■■■■■ 59.4
PCBP1Q15365 DHRSX-207ENST00000478825 679 ntTSL 225.22■■□□□ 1.632e-11■■■■■ 59.4
PCBP1Q15365 AMN-202ENST00000541086 2269 ntTSL 223.82■■□□□ 1.42e-11■■■■■ 59.4
PCBP1Q15365 DHRSX-203ENST00000430536 490 ntTSL 223.6■■□□□ 1.372e-11■■■■■ 59.4
PCBP1Q15365 DHRSX-202ENST00000412516 744 ntTSL 222.79■■□□□ 1.242e-11■■■■■ 59.4
PCBP1Q15365 AMN-203ENST00000558590 2772 ntTSL 220.06■□□□□ 0.82e-11■■■■■ 59.4
PCBP1Q15365 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.752e-11■■■■■ 59.4
PCBP1Q15365 DHRSX-205ENST00000444280 797 ntTSL 219.15■□□□□ 0.662e-11■■■■■ 59.4
PCBP1Q15365 DHRSX-204ENST00000441131 539 ntTSL 28.38□□□□□ -1.072e-11■■■■■ 59.4
PCBP1Q15365 ECH1-212ENST00000600178 1007 ntTSL 219.62■□□□□ 0.739e-10■■■■■ 59.4
PCBP1Q15365 ECH1-211ENST00000598707 882 ntTSL 218.99■□□□□ 0.639e-10■■■■■ 59.4
PCBP1Q15365 ECH1-213ENST00000601060 786 ntTSL 316.13■□□□□ 0.179e-10■■■■■ 59.4
PCBP1Q15365 ECH1-216ENST00000601778 799 ntTSL 515.85■□□□□ 0.139e-10■■■■■ 59.4
PCBP1Q15365 ECH1-202ENST00000594164 677 ntTSL 314.2□□□□□ -0.149e-10■■■■■ 59.4
PCBP1Q15365 ECH1-201ENST00000221418 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.169e-10■■■■■ 59.4
PCBP1Q15365 ECH1-204ENST00000595470 560 ntTSL 213.93□□□□□ -0.189e-10■■■■■ 59.4
PCBP1Q15365 AC008982.1-201ENST00000594769 963 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.279e-10■■■■■ 59.4
PCBP1Q15365 ECH1-210ENST00000598316 553 ntTSL 212.73□□□□□ -0.379e-10■■■■■ 59.4
PCBP1Q15365 AC008982.1-202ENST00000602021 342 ntTSL 58.83□□□□□ -19e-10■■■■■ 59.4
PCBP1Q15365 INO80E-211ENST00000567987 1926 ntTSL 1 (best)20.37■□□□□ 0.852e-9■■■■■ 59.4
PCBP1Q15365 INO80E-205ENST00000562441 1412 ntTSL 219.89■□□□□ 0.772e-9■■■■■ 59.4
PCBP1Q15365 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.752e-9■■■■■ 59.4
PCBP1Q15365 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.722e-9■■■■■ 59.4
PCBP1Q15365 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.532e-9■■■■■ 59.4
PCBP1Q15365 INO80E-208ENST00000567065 883 ntTSL 316.55■□□□□ 0.242e-9■■■■■ 59.4
PCBP1Q15365 INO80E-203ENST00000540562 3064 ntTSL 214.05□□□□□ -0.162e-9■■■■■ 59.4
PCBP1Q15365 INO80E-209ENST00000567254 625 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.172e-9■■■■■ 59.4
PCBP1Q15365 INO80E-213ENST00000569957 4469 ntTSL 212.78□□□□□ -0.362e-9■■■■■ 59.4
PCBP1Q15365 INO80E-204ENST00000562291 255 ntTSL 310.75□□□□□ -0.692e-9■■■■■ 59.4
PCBP1Q15365 MICU1-203ENST00000398763 1224 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.933e-10■■■■■ 59.3
PCBP1Q15365 AAMDC-205ENST00000526164 726 ntTSL 217.55■□□□□ 0.44e-6■■■■■ 59
PCBP1Q15365 AAMDC-207ENST00000527134 693 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.154e-6■■■■■ 59
PCBP1Q15365 AAMDC-210ENST00000532481 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.244e-6■■■■■ 59
PCBP1Q15365 AAMDC-201ENST00000304716 619 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.484e-6■■■■■ 59
PCBP1Q15365 AAMDC-212ENST00000630098 542 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.534e-6■■■■■ 59
PCBP1Q15365 AAMDC-208ENST00000529666 440 ntTSL 37.29□□□□□ -1.244e-6■■■■■ 59
PCBP1Q15365 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.093e-10■■■■■ 58.2
PCBP1Q15365 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.893e-10■■■■■ 58.2
PCBP1Q15365 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.813e-10■■■■■ 58.2
PCBP1Q15365 PI4KB-207ENST00000446339 566 ntTSL 318.05■□□□□ 0.483e-10■■■■■ 58.2
PCBP1Q15365 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.243e-10■■■■■ 58.2
PCBP1Q15365 PI4KB-208ENST00000455060 934 ntTSL 215.69■□□□□ 0.13e-10■■■■■ 58.2
PCBP1Q15365 NFIX-201ENST00000358552 1727 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.13e-10■■■■■ 58.2
PCBP1Q15365 DBF4B-202ENST00000393547 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.213e-10■■■■■ 58.2
PCBP1Q15365 ABHD4-204ENST00000489928 507 ntTSL 313.71□□□□□ -0.213e-10■■■■■ 58.2
PCBP1Q15365 PI4KB-201ENST00000368872 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.263e-10■■■■■ 58.2
PCBP1Q15365 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.273e-10■■■■■ 58.2
PCBP1Q15365 PI4KB-202ENST00000368873 3340 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.43e-10■■■■■ 58.2
Retrieved 100 of 13,035 protein–RNA pairs in 44.5 ms